More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0955 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  100 
 
 
699 aa  1405    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  95.14 
 
 
697 aa  1326    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  94.56 
 
 
697 aa  1318    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  64.74 
 
 
681 aa  858    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  63.17 
 
 
676 aa  848    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  72.6 
 
 
674 aa  1011    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  44.3 
 
 
665 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  42.31 
 
 
695 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  42.6 
 
 
687 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  43.07 
 
 
692 aa  501  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  42.64 
 
 
695 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  39.7 
 
 
680 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  41.23 
 
 
676 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  40.09 
 
 
681 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  42.84 
 
 
690 aa  485  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  43.19 
 
 
656 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  42.13 
 
 
683 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  43.27 
 
 
615 aa  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  41.16 
 
 
621 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  33.24 
 
 
651 aa  328  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  33.77 
 
 
651 aa  327  4.0000000000000003e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  33.77 
 
 
651 aa  326  7e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  33.53 
 
 
645 aa  326  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  32.61 
 
 
640 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  33.43 
 
 
646 aa  323  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  32.75 
 
 
640 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  29.77 
 
 
646 aa  282  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  45.56 
 
 
648 aa  276  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  46.59 
 
 
569 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  42.64 
 
 
533 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  58.05 
 
 
287 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  38.37 
 
 
577 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  37.96 
 
 
577 aa  193  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  34.05 
 
 
464 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  40.07 
 
 
490 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.92 
 
 
447 aa  187  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  39.46 
 
 
517 aa  183  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  33.16 
 
 
468 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  43.97 
 
 
471 aa  180  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  36.96 
 
 
581 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  43.53 
 
 
471 aa  177  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  39.31 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  38.52 
 
 
477 aa  175  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  38.11 
 
 
477 aa  175  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  41.63 
 
 
490 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  37.04 
 
 
741 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  37.74 
 
 
474 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  37.74 
 
 
475 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.24 
 
 
441 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  38.93 
 
 
475 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  38.93 
 
 
473 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  38.93 
 
 
473 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  37.64 
 
 
475 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  42.59 
 
 
362 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.6 
 
 
523 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  37.55 
 
 
429 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  38.35 
 
 
472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  35.03 
 
 
513 aa  164  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  37.34 
 
 
440 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  37.34 
 
 
440 aa  163  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  37.34 
 
 
437 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  39.27 
 
 
480 aa  163  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  33.84 
 
 
479 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  38.93 
 
 
472 aa  161  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  34.19 
 
 
430 aa  160  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  38.89 
 
 
503 aa  160  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  33.81 
 
 
448 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  39.66 
 
 
438 aa  158  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  31.44 
 
 
460 aa  158  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  37.85 
 
 
465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.96 
 
 
312 aa  154  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  35.57 
 
 
441 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  37.96 
 
 
527 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  38.49 
 
 
524 aa  154  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  33.91 
 
 
498 aa  153  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1433  peptidase M23B  33.59 
 
 
380 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.484783  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  38.72 
 
 
459 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  34.94 
 
 
470 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  32.95 
 
 
490 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  40.96 
 
 
435 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  34.29 
 
 
470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  35.8 
 
 
385 aa  147  9e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  36.33 
 
 
386 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.94 
 
 
491 aa  146  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  36.33 
 
 
386 aa  146  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  34.41 
 
 
462 aa  146  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  32.41 
 
 
468 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  33.97 
 
 
429 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  35.63 
 
 
491 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  38.68 
 
 
429 aa  144  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  37.11 
 
 
457 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  33.46 
 
 
433 aa  144  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  37.05 
 
 
417 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  34.7 
 
 
464 aa  144  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  34.18 
 
 
462 aa  144  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  36.03 
 
 
468 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  34.94 
 
 
475 aa  143  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  36.03 
 
 
468 aa  143  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  36.33 
 
 
386 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  36.03 
 
 
468 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>