More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1070 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  100 
 
 
470 aa  966    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  40.6 
 
 
475 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  39.53 
 
 
474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  41.23 
 
 
503 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  39.62 
 
 
472 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  41.21 
 
 
473 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  40.73 
 
 
475 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  38.85 
 
 
475 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  38.85 
 
 
473 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  45.12 
 
 
479 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  40.57 
 
 
468 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  40.38 
 
 
447 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.62 
 
 
517 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  44.09 
 
 
460 aa  329  8e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  37.37 
 
 
475 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  43.22 
 
 
480 aa  319  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  44 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  36.13 
 
 
470 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  38.7 
 
 
498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.75 
 
 
468 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  34.53 
 
 
468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.6 
 
 
468 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  42.18 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  35.17 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  35.17 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  35.39 
 
 
482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  34.96 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  42.86 
 
 
512 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  34.04 
 
 
468 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  33.9 
 
 
468 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  40.88 
 
 
475 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  37.47 
 
 
439 aa  297  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  36.52 
 
 
741 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  33.47 
 
 
472 aa  289  8e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  40.28 
 
 
490 aa  289  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  38.89 
 
 
462 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  37.11 
 
 
429 aa  286  8e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  36.91 
 
 
513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  37.88 
 
 
448 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  38.64 
 
 
441 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  38.16 
 
 
503 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  43.57 
 
 
353 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  41.08 
 
 
436 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  39.37 
 
 
472 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  34.8 
 
 
433 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  36.58 
 
 
490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  37.03 
 
 
441 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  37.22 
 
 
477 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  37.22 
 
 
477 aa  266  7e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  39.88 
 
 
417 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  36.36 
 
 
471 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  36.1 
 
 
471 aa  261  2e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  39.49 
 
 
423 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.31 
 
 
438 aa  257  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  38.92 
 
 
452 aa  254  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  43.56 
 
 
464 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.11 
 
 
465 aa  246  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  37.54 
 
 
441 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  35.75 
 
 
457 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.87 
 
 
430 aa  239  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  37.54 
 
 
462 aa  235  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  36.04 
 
 
523 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.8 
 
 
441 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  37.5 
 
 
470 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  35.91 
 
 
464 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  36.64 
 
 
457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  33.26 
 
 
465 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  37.01 
 
 
437 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  32.47 
 
 
490 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  37.06 
 
 
460 aa  224  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  36.99 
 
 
464 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  37.57 
 
 
465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  39.65 
 
 
454 aa  223  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  34.41 
 
 
464 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  39.65 
 
 
454 aa  223  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  33.73 
 
 
439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  34.5 
 
 
446 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.98 
 
 
569 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  35.94 
 
 
533 aa  216  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  32.22 
 
 
438 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  32.22 
 
 
438 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  37.06 
 
 
453 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  34.37 
 
 
410 aa  209  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  31.03 
 
 
435 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  31.75 
 
 
418 aa  202  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  30.44 
 
 
440 aa  202  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  29.93 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  33.82 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  29.93 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  29.93 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  32.57 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  30.33 
 
 
439 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  30.53 
 
 
439 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  35.4 
 
 
424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  31.14 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  31.14 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  31.14 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  31.14 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  31.14 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  31.14 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>