More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2993 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  56.51 
 
 
651 aa  696    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  53.99 
 
 
640 aa  658    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  56.71 
 
 
651 aa  695    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  56.35 
 
 
651 aa  696    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  100 
 
 
645 aa  1310    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  53.71 
 
 
646 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  53.65 
 
 
640 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  50.56 
 
 
648 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  43.63 
 
 
646 aa  525  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  37.14 
 
 
665 aa  355  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  34.65 
 
 
681 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  34.97 
 
 
680 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  34.4 
 
 
676 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  34.85 
 
 
695 aa  338  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  35.2 
 
 
692 aa  333  6e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  34.32 
 
 
695 aa  333  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  33.63 
 
 
697 aa  327  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  33.63 
 
 
697 aa  326  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  33.73 
 
 
699 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  34.73 
 
 
681 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  33.79 
 
 
687 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  33.75 
 
 
674 aa  316  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  34.74 
 
 
683 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  38.5 
 
 
690 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  49.26 
 
 
676 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  35.63 
 
 
615 aa  273  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  33.28 
 
 
656 aa  272  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  34.72 
 
 
621 aa  263  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.79 
 
 
569 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  40.65 
 
 
533 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  36.03 
 
 
490 aa  207  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  41.67 
 
 
464 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  41.96 
 
 
517 aa  193  8e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.42 
 
 
475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  40.42 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  40.16 
 
 
475 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  40.85 
 
 
473 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  39.76 
 
 
474 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  37.64 
 
 
741 aa  184  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  40 
 
 
472 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.49 
 
 
503 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  40.65 
 
 
468 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  40.65 
 
 
447 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  42.4 
 
 
471 aa  180  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  38.89 
 
 
577 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  41.94 
 
 
471 aa  178  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  38.46 
 
 
577 aa  178  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  39.26 
 
 
475 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  40.25 
 
 
490 aa  176  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  43.96 
 
 
429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  33.33 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  41.4 
 
 
581 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  40 
 
 
362 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  38.68 
 
 
523 aa  173  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  43.48 
 
 
440 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  43.48 
 
 
440 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  43.48 
 
 
437 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  41.26 
 
 
480 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  38.67 
 
 
470 aa  170  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  38.49 
 
 
524 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  38.52 
 
 
438 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  40.17 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  37.05 
 
 
441 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.52 
 
 
312 aa  164  7e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  37.3 
 
 
479 aa  163  9e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  39.08 
 
 
503 aa  162  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  37.76 
 
 
472 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  33.86 
 
 
490 aa  160  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  37.24 
 
 
513 aa  160  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.11 
 
 
441 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  55.07 
 
 
287 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.93 
 
 
448 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  34.17 
 
 
464 aa  157  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  36.67 
 
 
417 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  37.45 
 
 
465 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  36.73 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  40.72 
 
 
389 aa  154  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  40.31 
 
 
353 aa  154  7e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  35.06 
 
 
433 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  35.02 
 
 
429 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  39.13 
 
 
460 aa  151  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  35.6 
 
 
353 aa  150  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  33.47 
 
 
477 aa  150  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  33.47 
 
 
477 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  40.65 
 
 
465 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  40.93 
 
 
457 aa  148  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  34.25 
 
 
470 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  34.57 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  37.12 
 
 
430 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  36.51 
 
 
464 aa  146  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  53.17 
 
 
225 aa  146  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  34.78 
 
 
475 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  34.92 
 
 
491 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  36.67 
 
 
439 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  42.42 
 
 
402 aa  145  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  35.18 
 
 
475 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  37.44 
 
 
462 aa  144  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  34.02 
 
 
464 aa  144  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  35.1 
 
 
429 aa  143  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  40.76 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>