More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1103 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  71.54 
 
 		 491 aa  716    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  100 
 
 		 475 aa  976    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  76.88 
 
 		 475 aa  767    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  69.55 
 
 		 470 aa  682    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  63.99 
 
 		 468 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  63.79 
 
 		 468 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  63.79 
 
 		 468 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  63.43 
 
 		 466 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  62.93 
 
 		 468 aa  631  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  63.64 
 
 		 482 aa  628  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  63.79 
 
 		 468 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  63.22 
 
 		 466 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  63.22 
 
 		 491 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  59.77 
 
 		 512 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  60.21 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  61.31 
 
 		 462 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  46.34 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  44.63 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  45.47 
 
 		 433 aa  415  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  43.76 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  55.4 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  48.35 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  54.78 
 
 		 353 aa  392  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  49.44 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  36.27 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  44.01 
 
 		 474 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  42.13 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  40.46 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  43.61 
 
 		 475 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  43.14 
 
 		 503 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  36.89 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  38.22 
 
 		 517 aa  296  5e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  42.86 
 
 		 479 aa  289  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  41.39 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  36.12 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  39.95 
 
 		 513 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  41.18 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  41.18 
 
 		 473 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  41.5 
 
 		 473 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  39.24 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.23 
 
 		 480 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  35.66 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  38.19 
 
 		 741 aa  260  4e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  35.31 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  34.59 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  36.06 
 
 		 471 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  34.59 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  34.59 
 
 		 410 aa  236  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  36.06 
 
 		 471 aa  236  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  36.19 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  34.33 
 
 		 440 aa  233  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  35.28 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  35.21 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  34.15 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  30.61 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.38 
 
 		 477 aa  230  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  34.6 
 
 		 440 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  35.96 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.59 
 
 		 441 aa  224  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  34.07 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  35.91 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  33.42 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  34.9 
 
 		 419 aa  217  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  34.07 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  34.9 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  34.9 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  34.9 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  34.9 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  34.9 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  34.9 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  34.9 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  34.9 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  34.29 
 
 		 419 aa  216  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  34.08 
 
 		 486 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  33.6 
 
 		 457 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  33.79 
 
 		 423 aa  213  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  34.64 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  32.7 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  35.17 
 
 		 439 aa  209  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  33.14 
 
 		 435 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  33.52 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  38.54 
 
 		 457 aa  206  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  34.51 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  34.94 
 
 		 470 aa  206  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  34.1 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  33.82 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  34.1 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  34.1 
 
 		 433 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  34.1 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  34.29 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  34.66 
 
 		 439 aa  205  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  31.36 
 
 		 550 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  33.92 
 
 		 418 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  33.43 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>