More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3506 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  100 
 
 		 741 aa  1522    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  41.01 
 
 		 517 aa  317  7e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  42.54 
 
 		 490 aa  316  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  38.41 
 
 		 447 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  41.44 
 
 		 468 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  38.37 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.16 
 
 		 503 aa  301  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  40.29 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  40.61 
 
 		 475 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  38.21 
 
 		 474 aa  297  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  40.11 
 
 		 513 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  39.71 
 
 		 473 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  37.61 
 
 		 472 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  36.52 
 
 		 470 aa  291  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  38.37 
 
 		 475 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  38.37 
 
 		 473 aa  290  9e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  41.23 
 
 		 503 aa  286  9e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  39.89 
 
 		 459 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  37.59 
 
 		 448 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  39.59 
 
 		 470 aa  280  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  38.62 
 
 		 480 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  39.02 
 
 		 498 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  37.03 
 
 		 475 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  35.75 
 
 		 491 aa  264  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  36.2 
 
 		 477 aa  264  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  35.28 
 
 		 466 aa  263  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.99 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.99 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  39.03 
 
 		 468 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  36.19 
 
 		 472 aa  261  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  38.84 
 
 		 438 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  39.22 
 
 		 491 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.68 
 
 		 477 aa  260  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  39.03 
 
 		 468 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35.63 
 
 		 468 aa  260  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  35.04 
 
 		 466 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  39.89 
 
 		 475 aa  259  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  36.58 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  37.29 
 
 		 512 aa  258  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  38.16 
 
 		 437 aa  257  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  38.54 
 
 		 460 aa  256  8e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  38.84 
 
 		 439 aa  256  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  37.67 
 
 		 462 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  35.92 
 
 		 441 aa  253  7e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  40.7 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  37.01 
 
 		 430 aa  251  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  40.06 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  38.11 
 
 		 533 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  37.97 
 
 		 470 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  36.79 
 
 		 465 aa  247  6e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  35.97 
 
 		 457 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  33.06 
 
 		 490 aa  243  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.6 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  36.93 
 
 		 441 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  36.39 
 
 		 417 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  38.98 
 
 		 433 aa  238  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  45.1 
 
 		 523 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  40.25 
 
 		 436 aa  238  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  35.73 
 
 		 429 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  42.42 
 
 		 353 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.9 
 
 		 472 aa  233  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  34.19 
 
 		 423 aa  229  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  39.05 
 
 		 490 aa  228  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  33.9 
 
 		 452 aa  226  9e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34.16 
 
 		 471 aa  224  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  37.65 
 
 		 569 aa  223  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  33.88 
 
 		 471 aa  223  8e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  35.59 
 
 		 435 aa  223  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  36.83 
 
 		 440 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  36.83 
 
 		 440 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  37.13 
 
 		 437 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  34.66 
 
 		 465 aa  213  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  34.87 
 
 		 429 aa  211  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  33.6 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  33.71 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  43.33 
 
 		 464 aa  209  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  32.61 
 
 		 460 aa  207  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  34.97 
 
 		 429 aa  207  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  40.55 
 
 		 460 aa  205  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  38.1 
 
 		 465 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  39.26 
 
 		 457 aa  202  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  35.33 
 
 		 464 aa  201  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  32.36 
 
 		 417 aa  198  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  35.22 
 
 		 457 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  32.12 
 
 		 464 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  41.74 
 
 		 680 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  32.45 
 
 		 454 aa  194  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  32.45 
 
 		 454 aa  194  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  40.95 
 
 		 681 aa  193  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  39.59 
 
 		 687 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  34.15 
 
 		 550 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.1 
 
 		 446 aa  191  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  40.09 
 
 		 695 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  39.3 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  39.26 
 
 		 692 aa  189  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  38.84 
 
 		 690 aa  187  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  33.15 
 
 		 430 aa  186  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  41.2 
 
 		 665 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  35.44 
 
 		 676 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  30.81 
 
 		 406 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>