More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0732 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  100 
 
 
406 aa  830    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  46.38 
 
 
429 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  43 
 
 
417 aa  348  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  44.79 
 
 
435 aa  322  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  33.16 
 
 
470 aa  209  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  31.46 
 
 
503 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  33.92 
 
 
523 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  32.96 
 
 
468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  30.65 
 
 
465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  31.01 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  31.65 
 
 
472 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  31.82 
 
 
474 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  32.2 
 
 
447 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  33.43 
 
 
448 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  30.96 
 
 
473 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  30.96 
 
 
473 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  30.96 
 
 
475 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  33.23 
 
 
430 aa  192  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  32.23 
 
 
457 aa  190  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  31.4 
 
 
475 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  32.76 
 
 
490 aa  190  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  30.05 
 
 
441 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  36.59 
 
 
434 aa  189  8e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  30.05 
 
 
417 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  31.02 
 
 
517 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  31.05 
 
 
470 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  29.75 
 
 
741 aa  186  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  31.09 
 
 
439 aa  186  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  30.3 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  38.22 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  41.42 
 
 
429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  31.75 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.55 
 
 
441 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  35.06 
 
 
498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  40.85 
 
 
353 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  30.55 
 
 
512 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  37.8 
 
 
436 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  39.68 
 
 
465 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  37.85 
 
 
457 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  31.71 
 
 
533 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  37.5 
 
 
454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  28.57 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  38.43 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  37.5 
 
 
454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.82 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  32.1 
 
 
477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  30.58 
 
 
437 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  39.41 
 
 
464 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  29.5 
 
 
462 aa  172  9e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.43 
 
 
446 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  35.58 
 
 
385 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  30.34 
 
 
491 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  37.69 
 
 
464 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  39.57 
 
 
462 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  29.7 
 
 
460 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  33.46 
 
 
441 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  36.58 
 
 
460 aa  169  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  35.52 
 
 
480 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  38.74 
 
 
439 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  40.15 
 
 
471 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  40.15 
 
 
471 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  29.57 
 
 
482 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  37.6 
 
 
464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  30.59 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  29.95 
 
 
468 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  29.49 
 
 
438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  29.55 
 
 
491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  32.29 
 
 
388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  29.49 
 
 
438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  29.56 
 
 
410 aa  166  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  28.88 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  28.86 
 
 
440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  28.88 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  28.88 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  39.84 
 
 
490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  29.16 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  30.31 
 
 
466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  30.26 
 
 
475 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  29.38 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  33.84 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.71 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.96 
 
 
472 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  27.84 
 
 
440 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  30.31 
 
 
386 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  30.03 
 
 
386 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  30.31 
 
 
386 aa  160  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  27.11 
 
 
452 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  28.33 
 
 
440 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  28.61 
 
 
437 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  35.08 
 
 
465 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  28.33 
 
 
440 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  30.2 
 
 
475 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  26.93 
 
 
423 aa  158  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  27.68 
 
 
430 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  27.97 
 
 
404 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  31.76 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  31.89 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  29.01 
 
 
419 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  29.01 
 
 
440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  29.01 
 
 
440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>