More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1905 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  100 
 
 		 683 aa  1387    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  45.41 
 
 		 687 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  45.98 
 
 		 692 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  45.45 
 
 		 680 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  46.53 
 
 		 695 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  45.96 
 
 		 681 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  46.37 
 
 		 690 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  45.93 
 
 		 676 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  44.51 
 
 		 674 aa  500  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  42.71 
 
 		 699 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  41.8 
 
 		 695 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  41.8 
 
 		 697 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  41.93 
 
 		 697 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  41.6 
 
 		 665 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  41.46 
 
 		 681 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  41.11 
 
 		 676 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  37.24 
 
 		 651 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  36.79 
 
 		 651 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  37.09 
 
 		 651 aa  365  2e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  36.25 
 
 		 656 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  35.08 
 
 		 646 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  37.44 
 
 		 615 aa  343  8e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  35.49 
 
 		 645 aa  339  8e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  33.53 
 
 		 640 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  33.78 
 
 		 640 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  30.06 
 
 		 646 aa  302  1e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  44.23 
 
 		 621 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  38.31 
 
 		 648 aa  276  8e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  40.05 
 
 		 569 aa  276  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  34.37 
 
 		 533 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  38.04 
 
 		 490 aa  219  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  32.73 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  34 
 
 		 475 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  34.34 
 
 		 517 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  33.24 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  42.73 
 
 		 475 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  34.63 
 
 		 577 aa  183  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  42.73 
 
 		 473 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  40 
 
 		 741 aa  183  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  40.08 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  34.24 
 
 		 577 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  42.29 
 
 		 473 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  31.3 
 
 		 474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  43.5 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  40.08 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  40.53 
 
 		 475 aa  180  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  30.42 
 
 		 479 aa  179  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  55.19 
 
 		 287 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  29.76 
 
 		 470 aa  178  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  40 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  34.85 
 
 		 581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  38.52 
 
 		 429 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  39.22 
 
 		 441 aa  172  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  30.56 
 
 		 471 aa  171  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  36.07 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  38.3 
 
 		 437 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  37.87 
 
 		 440 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  37.87 
 
 		 440 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.06 
 
 		 477 aa  168  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  35.19 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.92 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  37.12 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.38 
 
 		 312 aa  164  7e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  29.03 
 
 		 430 aa  164  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.05 
 
 		 438 aa  163  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  37.95 
 
 		 459 aa  163  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  37.56 
 
 		 523 aa  161  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.06 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  32.55 
 
 		 490 aa  159  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  30.33 
 
 		 498 aa  158  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  31.65 
 
 		 503 aa  157  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  31.03 
 
 		 448 aa  157  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.51 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  34.16 
 
 		 513 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  29.82 
 
 		 460 aa  156  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  36.19 
 
 		 435 aa  153  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  37.9 
 
 		 417 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  30.18 
 
 		 437 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  31.83 
 
 		 491 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  31.46 
 
 		 464 aa  151  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  35.86 
 
 		 470 aa  151  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  37.83 
 
 		 389 aa  151  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  39.09 
 
 		 439 aa  150  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  33.46 
 
 		 402 aa  150  9e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  36.02 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  38.24 
 
 		 353 aa  148  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  30.73 
 
 		 464 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  34.11 
 
 		 524 aa  147  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  36.29 
 
 		 429 aa  147  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  33.46 
 
 		 386 aa  147  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  37.29 
 
 		 491 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  34.17 
 
 		 457 aa  146  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  39.49 
 
 		 527 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  30.11 
 
 		 462 aa  146  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  33.46 
 
 		 386 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  34.51 
 
 		 464 aa  146  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  31.76 
 
 		 462 aa  145  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  34.32 
 
 		 433 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  35.42 
 
 		 362 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  33.19 
 
 		 434 aa  144  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>