More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2450 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  71.7 
 
 		 423 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  100 
 
 		 428 aa  877    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  62 
 
 		 434 aa  551  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  62 
 
 		 431 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  62 
 
 		 431 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  61.52 
 
 		 431 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  62.47 
 
 		 419 aa  541  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  62.16 
 
 		 424 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  59.95 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  60.91 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  60.91 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  60.91 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  61.8 
 
 		 418 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  60.91 
 
 		 433 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  60.88 
 
 		 418 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  63.14 
 
 		 438 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  51.85 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  48.16 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  46.93 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  45.86 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  46.08 
 
 		 443 aa  292  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  41.26 
 
 		 482 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  35.55 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  40.71 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  39.05 
 
 		 440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  37.57 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  34.99 
 
 		 440 aa  241  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  39.42 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  38.48 
 
 		 486 aa  236  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  35.05 
 
 		 438 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  35.05 
 
 		 438 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  38.78 
 
 		 410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  40.24 
 
 		 550 aa  229  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  33.73 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  33.73 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  33.73 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  33.73 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  33.73 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  33.73 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  33.73 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  33.96 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  33.73 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  33.96 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  33.96 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  33.96 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  37.01 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  33.18 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  32.95 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  32.78 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  37.39 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  32.86 
 
 		 433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  37.54 
 
 		 507 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  30.82 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  33.33 
 
 		 491 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  31.74 
 
 		 436 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  33.04 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  33.04 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  33.04 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  32.82 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  31.47 
 
 		 468 aa  199  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  29.36 
 
 		 470 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  33.53 
 
 		 475 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  30.21 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  32.66 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  32.55 
 
 		 512 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  32.08 
 
 		 468 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  34.13 
 
 		 503 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  32.17 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.96 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  31.79 
 
 		 468 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  32.66 
 
 		 475 aa  193  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  33.24 
 
 		 475 aa  192  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  34.78 
 
 		 472 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  32.85 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  35.4 
 
 		 490 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  32.49 
 
 		 475 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  32.52 
 
 		 468 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  31.7 
 
 		 473 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  33.81 
 
 		 474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.62 
 
 		 470 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.29 
 
 		 472 aa  183  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  29.93 
 
 		 439 aa  183  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  33.43 
 
 		 503 aa  182  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  33.33 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  32.23 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  28.7 
 
 		 498 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  32.74 
 
 		 472 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.47 
 
 		 477 aa  178  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  31.63 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.09 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  34.6 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  31.78 
 
 		 513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  34.31 
 
 		 471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  31.81 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  31.52 
 
 		 490 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  31.99 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  32.78 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  31.13 
 
 		 741 aa  162  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  37.98 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>