More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3297 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  100 
 
 
448 aa  909    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  38.89 
 
 
445 aa  285  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  37.47 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  35.65 
 
 
475 aa  252  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  35.12 
 
 
452 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  37.89 
 
 
582 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  33.71 
 
 
446 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  30.64 
 
 
482 aa  202  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  33.55 
 
 
468 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  28.27 
 
 
468 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  47.92 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  57.02 
 
 
400 aa  136  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  35.98 
 
 
430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  36.58 
 
 
320 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  53.45 
 
 
460 aa  130  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  51.26 
 
 
309 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  53.78 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  52.68 
 
 
455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  53.72 
 
 
404 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  36.05 
 
 
402 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35.56 
 
 
301 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  54.63 
 
 
446 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  53.51 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  52.17 
 
 
375 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  40.46 
 
 
441 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  38.1 
 
 
453 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  50.82 
 
 
431 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  50.86 
 
 
379 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  53.7 
 
 
491 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43.37 
 
 
411 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  50.89 
 
 
454 aa  124  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  44.14 
 
 
340 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  55.26 
 
 
394 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  43.98 
 
 
305 aa  123  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  51.69 
 
 
404 aa  123  8e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  48.78 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  50.89 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  53.45 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  37.31 
 
 
375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  50.89 
 
 
392 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  54.55 
 
 
456 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.53 
 
 
376 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  53.85 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  50.4 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  51.79 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  53.7 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  53.7 
 
 
447 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  48.28 
 
 
442 aa  120  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  50.89 
 
 
392 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  51.79 
 
 
457 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  43.05 
 
 
372 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  54.39 
 
 
328 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  31.41 
 
 
539 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  54.55 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  50.86 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  44.88 
 
 
459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  31.72 
 
 
590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  32.81 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  53.7 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  51.3 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  45.31 
 
 
305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  51.85 
 
 
299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.31 
 
 
305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.31 
 
 
305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  50.93 
 
 
332 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  45.93 
 
 
414 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  53.98 
 
 
414 aa  117  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  53.85 
 
 
727 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  50 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  53.85 
 
 
727 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  53.1 
 
 
333 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  52.59 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  49.15 
 
 
305 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  48.36 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  37.05 
 
 
290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  41.76 
 
 
305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  49.58 
 
 
314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  42.86 
 
 
238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  32.43 
 
 
284 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  50 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  51.75 
 
 
751 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  56.7 
 
 
433 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  46.21 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  31.62 
 
 
294 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  54.55 
 
 
229 aa  113  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  46.21 
 
 
399 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  51.85 
 
 
301 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  33.21 
 
 
316 aa  113  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  51.75 
 
 
332 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  47.5 
 
 
373 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  51.69 
 
 
524 aa  113  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  29.17 
 
 
314 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  47.46 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  42.48 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  35.39 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  53.51 
 
 
195 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  53 
 
 
754 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  51.33 
 
 
358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  31.62 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  38.64 
 
 
348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>