More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0744 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  100 
 
 		 340 aa  683    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  61.56 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  48.66 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  50.96 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  50 
 
 		 327 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  48.26 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  48.22 
 
 		 316 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  49.48 
 
 		 290 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  37.58 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  41.23 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  47.98 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  40 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  44.07 
 
 		 288 aa  189  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  44.06 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  46.28 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  41.67 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  40.85 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  38.66 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  38.66 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  39.41 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  37.7 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  32.89 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  32.72 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.13 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.27 
 
 		 454 aa  149  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.65 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  34.53 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  44.62 
 
 		 459 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  43.59 
 
 		 456 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  42.64 
 
 		 453 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.93 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  33.97 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.54 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.54 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  42.65 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35.12 
 
 		 305 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  42.05 
 
 		 455 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  35.06 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.08 
 
 		 321 aa  142  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.88 
 
 		 402 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  60.16 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  35.99 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  34.71 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  39.58 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  39.17 
 
 		 384 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  36.91 
 
 		 299 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  52.59 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  33.45 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  31.94 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  35.44 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  42.86 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  45.32 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  48.46 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  56.1 
 
 		 243 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  35.86 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  37.22 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  50.99 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  35.19 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  54.47 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  35.86 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  35.86 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  40.93 
 
 		 442 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  34.62 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  54.55 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  35.86 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  30.12 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  45.83 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  35.16 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  35.02 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  29.93 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  52.31 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  44.81 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  33.6 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  45.64 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  30.41 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  42.16 
 
 		 413 aa  129  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  35.22 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.24 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  46.98 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  35.65 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  35.65 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  53.66 
 
 		 238 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  32.08 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  35.65 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  35.65 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  34.57 
 
 		 460 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  35.44 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  42.78 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  35.02 
 
 		 299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  41.82 
 
 		 309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  55.17 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  35.48 
 
 		 423 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.78 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.02 
 
 		 445 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  50 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  36.99 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  47.93 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  29.33 
 
 		 302 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  44.14 
 
 		 448 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  34.17 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>