More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0954 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  100 
 
 		 433 aa  893    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  58.06 
 
 		 448 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  56.87 
 
 		 448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  46.9 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  45.15 
 
 		 433 aa  388  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  43.9 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  45.1 
 
 		 436 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  43.33 
 
 		 435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  43.83 
 
 		 448 aa  356  5e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  41.63 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  42.4 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  35.95 
 
 		 434 aa  226  6e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  34.38 
 
 		 456 aa  206  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  34.97 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  31.98 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  29.18 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  32.23 
 
 		 431 aa  196  9e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  32.39 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  30.17 
 
 		 457 aa  186  9e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  33.91 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  28.31 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  56.7 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  38.51 
 
 		 306 aa  106  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  45.1 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  47.42 
 
 		 375 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  37.65 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  35.75 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  52.58 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  32.84 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  44.44 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  33.86 
 
 		 294 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  44.9 
 
 		 375 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  50 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  40.26 
 
 		 404 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  41.55 
 
 		 541 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  45.36 
 
 		 301 aa  99.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  35.75 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  48.45 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  50 
 
 		 303 aa  98.2  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  31.66 
 
 		 373 aa  98.2  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  44.26 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  40.46 
 
 		 291 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  48.98 
 
 		 377 aa  97.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  45 
 
 		 446 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  48.94 
 
 		 379 aa  96.7  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  34.08 
 
 		 244 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  30.08 
 
 		 269 aa  95.9  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  38.57 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  38.41 
 
 		 417 aa  95.5  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  44.33 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  44.33 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  37.34 
 
 		 441 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  43.93 
 
 		 320 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  43.88 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  49.48 
 
 		 328 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  43.3 
 
 		 301 aa  93.6  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  44.33 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  38.93 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  40.2 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  34.57 
 
 		 285 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  43.16 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  40.71 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  48.94 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  48.42 
 
 		 452 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  32.84 
 
 		 300 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  33.12 
 
 		 268 aa  90.9  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  35.85 
 
 		 300 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  36.23 
 
 		 286 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  43.59 
 
 		 414 aa  90.1  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  42.42 
 
 		 298 aa  89.7  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  41.84 
 
 		 305 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  41.84 
 
 		 305 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  30.85 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  48.45 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40.82 
 
 		 305 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  44.33 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  44.44 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  42.98 
 
 		 290 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  42.86 
 
 		 305 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  31.43 
 
 		 271 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  45.74 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  44.44 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  44.9 
 
 		 216 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  27.57 
 
 		 285 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  40.82 
 
 		 318 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.36 
 
 		 457 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  47.96 
 
 		 582 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  45.74 
 
 		 277 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  41.05 
 
 		 314 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  43 
 
 		 321 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  37.62 
 
 		 295 aa  87.4  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  44.21 
 
 		 376 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  45.19 
 
 		 539 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  44.44 
 
 		 284 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  33.68 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  30.11 
 
 		 285 aa  87  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  40.48 
 
 		 498 aa  86.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  37.41 
 
 		 336 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>