More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1189 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  100 
 
 		 441 aa  905    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1311  peptidase M23B  51.38 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000378808  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  51.45 
 
 		 436 aa  441  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  47.61 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0954  peptidase M23B  41.63 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000982445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3500  peptidase M23B  40.23 
 
 		 448 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3569  Peptidase M23  40 
 
 		 448 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2965  putative peptidase  39.77 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000753312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0762  Peptidase M23  40.39 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.788774  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1778  Peptidase M23  39.67 
 
 		 448 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000277073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0512  peptidase M23B  37.8 
 
 		 453 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0024686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1776  Peptidase M23  34.07 
 
 		 434 aa  225  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1684  peptidase M23B  29.96 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0242  Peptidase M23  31.07 
 
 		 456 aa  223  6e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1296  tyrosyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000911619  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0217  peptidase, M23/M37 family  30.53 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000191836  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2224  peptidase M23B  30.8 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000268272  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0671  peptidase M23B  30.57 
 
 		 431 aa  210  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0143037  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0144  M24/M37 family peptidase  32.22 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000389658  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1499  peptidase M23B  32.67 
 
 		 456 aa  205  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0166  M24/M37 family peptidase  32.49 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000141414  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0126  M24/M37 family peptidase  32.24 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  26.56 
 
 		 306 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  36.97 
 
 		 285 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  45.92 
 
 		 375 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  43.43 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  37.41 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  41.35 
 
 		 285 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  43.44 
 
 		 318 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  49.47 
 
 		 541 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  28.38 
 
 		 404 aa  94  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.43 
 
 		 266 aa  94  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  43.44 
 
 		 319 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  43.44 
 
 		 321 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  45.92 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  42.86 
 
 		 404 aa  93.2  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  31.66 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  40.6 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  31.98 
 
 		 273 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  44 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  45 
 
 		 304 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.43 
 
 		 376 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  38.81 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  45.1 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  38.1 
 
 		 328 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.31 
 
 		 309 aa  90.1  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.31 
 
 		 268 aa  90.1  7e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  35.22 
 
 		 286 aa  90.1  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  31.08 
 
 		 244 aa  90.1  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  36.5 
 
 		 367 aa  89.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  46.94 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.03 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  39.42 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  41.35 
 
 		 374 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.32 
 
 		 372 aa  87.4  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  35.97 
 
 		 283 aa  87  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  43.43 
 
 		 402 aa  87  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  38.64 
 
 		 255 aa  87  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.57 
 
 		 431 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  43.62 
 
 		 379 aa  86.7  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  40.59 
 
 		 374 aa  86.3  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  39.22 
 
 		 301 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  31.48 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  40.78 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  43.56 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  36.73 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  43 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  41.9 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  44.44 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  38.68 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  38.46 
 
 		 610 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  42.57 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  42.16 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  37.17 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  33.33 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  34.42 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  42.16 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  44.33 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  42.16 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  41.49 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  38.64 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  29.09 
 
 		 469 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  41 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  38.39 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  42.16 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  38.84 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  38.79 
 
 		 277 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  39.6 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  43.3 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  33.77 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  42.27 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  40.38 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  39.6 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  35.16 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  34.75 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  39.34 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  36.73 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  41.84 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  40.95 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  42 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>