More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0953 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  100 
 
 		 336 aa  672    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  44.86 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  45.33 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  45.27 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  39.65 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  43.61 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  33.56 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  41.62 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  42.7 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  38.85 
 
 		 282 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  39.17 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  39.17 
 
 		 275 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  39.17 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  38.75 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  39.15 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  43.98 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  43.45 
 
 		 273 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 		 266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  46.24 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  34.71 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  42.26 
 
 		 244 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  38.89 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  41.01 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  47.02 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  36.89 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  32.78 
 
 		 274 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  33.77 
 
 		 274 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  36.67 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  45.51 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  42.05 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  36.93 
 
 		 269 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  42.37 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  37.05 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  37.89 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  38.26 
 
 		 322 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  42.6 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  42.6 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  45.24 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  33.89 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  37.12 
 
 		 296 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  42.35 
 
 		 263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  42.61 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.8 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.91 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  39.77 
 
 		 280 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  34.86 
 
 		 286 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  30.88 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  40.35 
 
 		 306 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  35.43 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  38.59 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  41.01 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  39.49 
 
 		 395 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  42.41 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  49.21 
 
 		 141 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  34.04 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  33.83 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  37.11 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  38.83 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  32.46 
 
 		 278 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  37.57 
 
 		 282 aa  116  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  36.9 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  34.86 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  44.96 
 
 		 299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  36.57 
 
 		 269 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  31.84 
 
 		 313 aa  113  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  41.57 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  44.08 
 
 		 457 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  44.08 
 
 		 459 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  39.31 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  37.87 
 
 		 375 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  38.07 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  34.52 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  38.07 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  44.08 
 
 		 456 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  35.84 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  30.35 
 
 		 287 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  32.79 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  30.35 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  31.96 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  33.75 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  29.85 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.18 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  29.85 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  31.44 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  44.96 
 
 		 248 aa  106  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.76 
 
 		 455 aa  106  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  31.41 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  39.53 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  44.63 
 
 		 482 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.79 
 
 		 455 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  42.86 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  41.55 
 
 		 469 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  45.45 
 
 		 232 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  33.51 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  47.46 
 
 		 524 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  39.47 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  36.25 
 
 		 282 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  40.79 
 
 		 453 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  39.86 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>