More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1721 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  100 
 
 		 317 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  52.55 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  43.23 
 
 		 313 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  47.16 
 
 		 336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  40.28 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  42.47 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  42.22 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  39.3 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  40.91 
 
 		 296 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  44.91 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  40.98 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  37.23 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  35.07 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  38.99 
 
 		 322 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  37.27 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  35.82 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  38.57 
 
 		 280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  36.61 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  35.11 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  35.23 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  35 
 
 		 306 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  34.4 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  39.53 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  37.44 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  37.22 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  33.64 
 
 		 268 aa  134  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  43.93 
 
 		 274 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  35.05 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  32.58 
 
 		 269 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  35.51 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  35.16 
 
 		 266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  36.31 
 
 		 273 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  33.45 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  38.92 
 
 		 275 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  38.69 
 
 		 275 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  34.62 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  41.89 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  40.54 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.6 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  39.59 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.27 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  32.36 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  33.96 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  32.46 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  46.72 
 
 		 141 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  39.08 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  41.94 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  35.11 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  36.15 
 
 		 272 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  38.46 
 
 		 321 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  38.46 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  35.5 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  36.81 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  36.94 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  36.81 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  37.36 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  40.49 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  27.43 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.45 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  31.9 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  42.58 
 
 		 453 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  42.41 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  48.48 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  36.9 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  39.31 
 
 		 459 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  44.7 
 
 		 456 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  43.66 
 
 		 392 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  39.1 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  45.11 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  41.14 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.27 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  33.85 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  34.62 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  35.92 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  36.32 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  31.28 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  46.88 
 
 		 415 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  31.79 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  41.73 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  31.64 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  38.85 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  35.5 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  44.36 
 
 		 382 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  42.18 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  44.44 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  43.09 
 
 		 469 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40.98 
 
 		 404 aa  97.8  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  44.17 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  41.09 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  43.55 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  45 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  38.99 
 
 		 230 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  44 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  29.61 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  35.2 
 
 		 278 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  44.17 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  38.97 
 
 		 430 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  46.61 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  43.51 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  45 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>