More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1445 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  100 
 
 		 274 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  97.08 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  83.58 
 
 		 273 aa  461  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  76.98 
 
 		 282 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  76.62 
 
 		 282 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  81.5 
 
 		 275 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  81.5 
 
 		 275 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  81.1 
 
 		 275 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  80.71 
 
 		 275 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  75.38 
 
 		 280 aa  407  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  73.12 
 
 		 274 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  50.93 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  49.2 
 
 		 316 aa  228  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  47.77 
 
 		 263 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  48.58 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  47.77 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  47.98 
 
 		 296 aa  221  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  45.68 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  45.04 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  45.75 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  47.88 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.86 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  38.2 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  58.46 
 
 		 141 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  43.2 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  40.55 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  44.91 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  41.53 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  38.25 
 
 		 291 aa  141  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  32.84 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  40.66 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  41.92 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  41.9 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  40.22 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  39.13 
 
 		 285 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  39.13 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  39.78 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  35.11 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.22 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  34.91 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  45.24 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  37.5 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  39.5 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  38.04 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  37.93 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37.93 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  31.17 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  30.77 
 
 		 328 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  36.6 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  36.11 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  30.83 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  30.77 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  38.07 
 
 		 302 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  35.52 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  36.76 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  35.48 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  34.78 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  37.57 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  47.62 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  36.81 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  35.75 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  34.83 
 
 		 269 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  35.87 
 
 		 287 aa  118  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.33 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  35.43 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  34.64 
 
 		 313 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  34.64 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  35.07 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  34.64 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  35.56 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  34.08 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  34.08 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  32.63 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  34.64 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  35 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  34.64 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  30.43 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  32.73 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  35.71 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  34.08 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  38.99 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  35.98 
 
 		 255 aa  109  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.07 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  41.38 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  40.69 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  40.69 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.12 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  45.45 
 
 		 450 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  33.17 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  32.08 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  42 
 
 		 445 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  40.58 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  40.16 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  35.56 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  38.02 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  30.25 
 
 		 301 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  39.31 
 
 		 305 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  36.02 
 
 		 395 aa  99  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  45.67 
 
 		 455 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>