More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1026 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  98.91 
 
 		 275 aa  550  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  96.73 
 
 		 275 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  93.82 
 
 		 275 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  85.77 
 
 		 273 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  78.62 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  78.26 
 
 		 274 aa  427  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  72.63 
 
 		 282 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  72.98 
 
 		 282 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  70.92 
 
 		 274 aa  374  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  70.08 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  51.61 
 
 		 271 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  51.22 
 
 		 263 aa  238  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  50.41 
 
 		 296 aa  234  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  48.58 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  49.19 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  48.78 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  46.06 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  45.87 
 
 		 277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  45.53 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  45.35 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  37.36 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.96 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  39.72 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  55.4 
 
 		 141 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  40.93 
 
 		 336 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  45.51 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  38.75 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  40.56 
 
 		 291 aa  148  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  41.24 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  39.67 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  39.89 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  36.87 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  39.57 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  37.78 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  39.46 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  33.74 
 
 		 285 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32.87 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  37.78 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  31.45 
 
 		 328 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  37.02 
 
 		 282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  28.69 
 
 		 285 aa  132  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.41 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  42.17 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  39.29 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  34.08 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  35.8 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.5 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  33.08 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  37.29 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  35.33 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  35.91 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  31.69 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  31.28 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  31.28 
 
 		 319 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.22 
 
 		 305 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  35.16 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  37.98 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  34.31 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  37.57 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  35.59 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  35.91 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  35.36 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  35.91 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  34.81 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  35.36 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  31.33 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  35.36 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  34.81 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  34.25 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  35.59 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  33.52 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36.2 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  30.47 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  34.81 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  30.37 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  45.16 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  32.74 
 
 		 312 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  41.6 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.72 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.12 
 
 		 321 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  29.24 
 
 		 286 aa  108  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  39.73 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.04 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.04 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  38.51 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  35.03 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  31.47 
 
 		 300 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  39.04 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.88 
 
 		 453 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  36.1 
 
 		 454 aa  105  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.73 
 
 		 411 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  40.16 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  37.5 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  35.76 
 
 		 309 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.78 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>