More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1342 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  100 
 
 		 296 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  72.15 
 
 		 322 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  71.98 
 
 		 263 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  72.37 
 
 		 296 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  65.38 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  64.07 
 
 		 289 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  62.65 
 
 		 290 aa  298  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  80.85 
 
 		 141 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  52.02 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  48.18 
 
 		 275 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  48.58 
 
 		 275 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  48.18 
 
 		 275 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  46.96 
 
 		 275 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  47.98 
 
 		 274 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  48.79 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  47.98 
 
 		 274 aa  221  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  47.98 
 
 		 282 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  45.85 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  45.34 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  47.83 
 
 		 274 aa  212  5.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  46.91 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  45.24 
 
 		 277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  42.92 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  42.45 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  40.19 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  40.65 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  38.29 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  39.46 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  38.68 
 
 		 336 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  41.79 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  36.94 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  41.62 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  41.62 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.31 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  37.32 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.33 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  32 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  32.59 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  38.81 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  37.56 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  37.22 
 
 		 282 aa  119  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  33.87 
 
 		 306 aa  118  9e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  41.71 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  34.21 
 
 		 283 aa  116  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  34.42 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  36.67 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  34.78 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  38.6 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  35.94 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  40.21 
 
 		 278 aa  113  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  38.24 
 
 		 232 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  37.14 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  34.86 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.5 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  31.95 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  32.22 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  30.43 
 
 		 321 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  43.97 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  29.52 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  35.8 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  36.36 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  36.36 
 
 		 287 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  35.8 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  30.43 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  35.8 
 
 		 306 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  32.96 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  44.07 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  35.75 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  34.66 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  35.5 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  35.23 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  42.62 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  34.66 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  35.03 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  43.09 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  28.98 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  33.5 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  35.71 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  40.65 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  36.71 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  42.4 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  40.16 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  32.88 
 
 		 312 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.18 
 
 		 375 aa  93.2  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.74 
 
 		 321 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  41.67 
 
 		 413 aa  92.4  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.46 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.09 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  40.8 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  36.75 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35.95 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  38.02 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  38.64 
 
 		 498 aa  90.1  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  42.24 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44 
 
 		 453 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.29 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.29 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  39.52 
 
 		 238 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  43.22 
 
 		 456 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>