More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3107 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  100 
 
 		 303 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  56.4 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  58.16 
 
 		 284 aa  241  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  44.92 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  40.56 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  41.98 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  40.42 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  41.3 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  40.55 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  41.77 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  40.16 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  40.42 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  40.16 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  42.5 
 
 		 306 aa  189  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  40.89 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  42.08 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  42.08 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  40.49 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  40.89 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  41.98 
 
 		 282 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  44.63 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  42 
 
 		 278 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.47 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  43.8 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  36.12 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  42.37 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  42.37 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  42.73 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  33.06 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  36.18 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  34.8 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  43.15 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  37.82 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  37.37 
 
 		 274 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  33.78 
 
 		 275 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  44.03 
 
 		 274 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  36.04 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  37.37 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  32.89 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  33.33 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  37.22 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  32.89 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  37.57 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  35.64 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  37.02 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  40.71 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  33.48 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  33.66 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  35.08 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.05 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  30.05 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.46 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  33.78 
 
 		 266 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  38.22 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  27.23 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  37.16 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  35.96 
 
 		 313 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  36.05 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  29.5 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  35.9 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  37.41 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  36.46 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  33.02 
 
 		 283 aa  99.8  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  43.9 
 
 		 141 aa  99.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  40.4 
 
 		 272 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  39.07 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  45.67 
 
 		 412 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  26.8 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  35.19 
 
 		 336 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  35.43 
 
 		 367 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  42.62 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  33.33 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  36 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  38.13 
 
 		 430 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  35.06 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  39.53 
 
 		 404 aa  95.5  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  45.54 
 
 		 399 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  40.94 
 
 		 507 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  42.5 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  39.19 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  35.37 
 
 		 318 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  37.84 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  45.54 
 
 		 399 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  37.9 
 
 		 395 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  32.06 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  38 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  40.87 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  35.37 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  44.09 
 
 		 420 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  36.6 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  35.37 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  42.86 
 
 		 425 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  38.76 
 
 		 439 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  37.5 
 
 		 433 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  44.09 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  37.5 
 
 		 433 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  37.5 
 
 		 433 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  44.09 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  37.5 
 
 		 433 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  44.09 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>