More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3376 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  100 
 
 		 269 aa  550  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  53.41 
 
 		 313 aa  294  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  54.65 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  53.76 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  54.65 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  54.26 
 
 		 312 aa  288  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  53.46 
 
 		 287 aa  288  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  53.01 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  50.56 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  52.94 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  52.94 
 
 		 311 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  48.88 
 
 		 286 aa  279  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  54.92 
 
 		 278 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  53.88 
 
 		 301 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  53.88 
 
 		 282 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  53.06 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  53.08 
 
 		 282 aa  269  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  53.25 
 
 		 288 aa  265  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  52.87 
 
 		 305 aa  265  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  53.06 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  51.82 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  49.79 
 
 		 279 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  46.94 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  45.53 
 
 		 285 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  45.53 
 
 		 272 aa  234  9e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  47.92 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  39.43 
 
 		 299 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  42.65 
 
 		 232 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  39.61 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  36.4 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  39.7 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  36 
 
 		 271 aa  141  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  36.18 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  41.95 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  42.59 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  39.44 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  38.04 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  37.56 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  38.29 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  33.7 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  36.46 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  34.25 
 
 		 275 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  34.25 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  37.06 
 
 		 322 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  41.46 
 
 		 321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  40.83 
 
 		 319 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  40.85 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  36.81 
 
 		 328 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  35.33 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  33.76 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  32.32 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  35.16 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  39.66 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  33.15 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  32.42 
 
 		 273 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  36.57 
 
 		 336 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  33.7 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  37.36 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  45.53 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  45.53 
 
 		 263 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  45.9 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31.55 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  31.02 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  44.72 
 
 		 141 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  29.41 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  36.61 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  39.1 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.48 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  32.26 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  33.7 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  31.84 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  35.71 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.14 
 
 		 293 aa  96.3  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  35.64 
 
 		 312 aa  96.3  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  36.57 
 
 		 395 aa  95.9  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.28 
 
 		 321 aa  95.9  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  34.1 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  30.41 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  36.11 
 
 		 306 aa  92.4  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  31.76 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  33.33 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  39.44 
 
 		 372 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  33.92 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.89 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.11 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35.11 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.11 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  42.28 
 
 		 482 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  45.83 
 
 		 418 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  45.83 
 
 		 419 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  30.12 
 
 		 452 aa  87  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  35.88 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  30.35 
 
 		 376 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  43.09 
 
 		 507 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  34.36 
 
 		 320 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  47.22 
 
 		 523 aa  85.9  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  44.79 
 
 		 433 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  34.44 
 
 		 294 aa  85.5  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>