More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1296 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  100 
 
 		 276 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  50.2 
 
 		 302 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  49.59 
 
 		 313 aa  269  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  47.58 
 
 		 282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  46.69 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  48.18 
 
 		 312 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  47.56 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  47.37 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  48.98 
 
 		 282 aa  262  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  47.37 
 
 		 287 aa  261  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  45.49 
 
 		 301 aa  260  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  48.52 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  44.57 
 
 		 311 aa  258  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  45.11 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  44.85 
 
 		 287 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  43.94 
 
 		 286 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  50.41 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  44.49 
 
 		 282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  49.26 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.82 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  45.38 
 
 		 280 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  43.87 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  42.34 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  43.49 
 
 		 285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  47.13 
 
 		 279 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  48.95 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  45.97 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  39.25 
 
 		 299 aa  161  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  43.96 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  38.17 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  36.33 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  38.07 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  40.84 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  40.66 
 
 		 328 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  40.84 
 
 		 282 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  40.33 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  39.78 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  39.23 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  40.56 
 
 		 275 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  40 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  35.62 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  40.56 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  48.98 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  36.7 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  40 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  38.8 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  38.69 
 
 		 322 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  37.22 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  51.22 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  36.67 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  39.5 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  36.56 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  37.09 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  50.41 
 
 		 141 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  39 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  34.65 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  34.65 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  43.03 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  43.03 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  43.03 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  41.3 
 
 		 316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  34.65 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  36.46 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  40 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  37.93 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  39.25 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.58 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.47 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  39.05 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  33.68 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  35.63 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  39.33 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.93 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  29.82 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  40.11 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  37.13 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  38.93 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  29.43 
 
 		 299 aa  99.4  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  36.84 
 
 		 395 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  47.97 
 
 		 283 aa  96.3  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  30.21 
 
 		 306 aa  95.9  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33 
 
 		 316 aa  95.5  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.65 
 
 		 309 aa  95.5  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  39.62 
 
 		 294 aa  95.5  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  40.24 
 
 		 649 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  34.74 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  41.82 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  48.48 
 
 		 669 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  39.86 
 
 		 507 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  41.46 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  40.38 
 
 		 379 aa  90.5  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  41.46 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  35.45 
 
 		 482 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  38.46 
 
 		 418 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  40 
 
 		 374 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  40.65 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  39.57 
 
 		 433 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  43.2 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  39.57 
 
 		 433 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>