More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2203 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  100 
 
 		 313 aa  627  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  56.13 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  43.56 
 
 		 299 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  44.88 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  43.23 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  40.67 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  46.12 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  45.33 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  42.61 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  43.05 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  42.6 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  43.2 
 
 		 275 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  44.34 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  41.96 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  43.4 
 
 		 282 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  42.23 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  42.23 
 
 		 275 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  42.72 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  41.78 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  43.2 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  40.57 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  43.2 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  37.85 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  37.08 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  40.27 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  40.44 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  42.2 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  33.96 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  40.95 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  39.11 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36.67 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  39.35 
 
 		 296 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  35.12 
 
 		 285 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  37.84 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  39.34 
 
 		 280 aa  139  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  33.98 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  36.22 
 
 		 244 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  39.71 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  50.41 
 
 		 141 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  37.66 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  35.14 
 
 		 266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  38.22 
 
 		 306 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  34.46 
 
 		 269 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  37.21 
 
 		 278 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  38.12 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.52 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  37.36 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.55 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  37.36 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  34.42 
 
 		 279 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  36.28 
 
 		 281 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  39.63 
 
 		 286 aa  123  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  40.12 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  40.36 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  33.15 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  35.23 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  36.36 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  39.23 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  36.31 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  36.31 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  34.27 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  36.46 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  35.56 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  51.26 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  46.55 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  33.89 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  50.42 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  35.71 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  35.71 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  33.89 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  34.46 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  49.17 
 
 		 524 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  35.33 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  34.31 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  35.16 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  38.24 
 
 		 375 aa  112  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  35.16 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  34.76 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  33.89 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  34.62 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  33.89 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  38.14 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  45.32 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  42.54 
 
 		 395 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  36.81 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  33.89 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  46.51 
 
 		 414 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  47.24 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  41.83 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  42.64 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  45.83 
 
 		 469 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.09 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.42 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  38.98 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  46.02 
 
 		 498 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  44.44 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  47.54 
 
 		 538 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39.44 
 
 		 455 aa  102  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.5 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05623  hypothetical protein  45.31 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>