More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1364 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  100 
 
 
263 aa  526  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  97.34 
 
 
296 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  72.55 
 
 
296 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  73.23 
 
 
322 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  71.05 
 
 
316 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  68.7 
 
 
289 aa  318  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  61.35 
 
 
290 aa  288  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  87.23 
 
 
141 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  51.22 
 
 
275 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  49.59 
 
 
275 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  50.81 
 
 
275 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  51.01 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  51.82 
 
 
274 aa  231  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  49.19 
 
 
275 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  50.2 
 
 
282 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  49.8 
 
 
282 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  48 
 
 
271 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  47.77 
 
 
274 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  47.37 
 
 
274 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  45.12 
 
 
273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  45.45 
 
 
272 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  43.31 
 
 
277 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  40.48 
 
 
300 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  40.08 
 
 
300 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  43.05 
 
 
313 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  44.91 
 
 
317 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  43.33 
 
 
336 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  45.35 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  41.21 
 
 
282 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  42.86 
 
 
285 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  42.86 
 
 
272 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  35.37 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  38.55 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  34.93 
 
 
291 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  43.39 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  36.87 
 
 
286 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  36.11 
 
 
287 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  35.17 
 
 
321 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  39.5 
 
 
276 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  35.17 
 
 
319 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  35.19 
 
 
318 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  34.27 
 
 
269 aa  121  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  43.33 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  31.16 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  31.12 
 
 
285 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  38.42 
 
 
282 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  36.1 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  37.56 
 
 
280 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  35.97 
 
 
283 aa  119  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  35.2 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  45.2 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  33.89 
 
 
280 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  38.55 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  46.03 
 
 
285 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  35.39 
 
 
287 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  37.79 
 
 
285 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  35.39 
 
 
312 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  35.39 
 
 
312 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  31.43 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  31.78 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  35.2 
 
 
306 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  35.39 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  40.36 
 
 
286 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  31.43 
 
 
244 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  34.64 
 
 
301 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31.43 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  34.64 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  34.08 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  36 
 
 
288 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  34.27 
 
 
287 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
255 aa  110  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  38.2 
 
 
312 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  34.39 
 
 
269 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  36.67 
 
 
299 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  45.38 
 
 
232 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.43 
 
 
305 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.18 
 
 
293 aa  102  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  34.25 
 
 
284 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  45.3 
 
 
303 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  35.75 
 
 
375 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  37.8 
 
 
375 aa  98.2  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  35.62 
 
 
469 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.8 
 
 
321 aa  96.3  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  37.59 
 
 
286 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  42.62 
 
 
303 aa  95.5  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.9 
 
 
238 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  34.02 
 
 
294 aa  95.5  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  42.86 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.46 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  33.9 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  39.18 
 
 
376 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  46.9 
 
 
375 aa  92.8  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  41.46 
 
 
377 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  45.08 
 
 
243 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  38.18 
 
 
300 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  47.66 
 
 
388 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  36.77 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  36.53 
 
 
328 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  41.86 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  41.8 
 
 
309 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>