More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0304 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  547  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  98.53 
 
 		 285 aa  542  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  74.9 
 
 		 279 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  70.3 
 
 		 281 aa  358  8e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  46.86 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  45.53 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  43.55 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  43.95 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  45.68 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  43.55 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  43.75 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  44.44 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  43.2 
 
 		 311 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  42.21 
 
 		 286 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  45.08 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  42.5 
 
 		 282 aa  215  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  46.81 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  43.13 
 
 		 282 aa  215  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  43.33 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  42.21 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  43.75 
 
 		 312 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  42.92 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  43.75 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  42.5 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  42.08 
 
 		 288 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  42.44 
 
 		 299 aa  174  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.92 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  41.1 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  43.5 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  39.18 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  41.51 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  41.77 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  44.56 
 
 		 322 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  38.89 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  41.5 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  48.37 
 
 		 284 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  38.86 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  38.43 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  37.24 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  39.13 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  39.13 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  37.5 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  37.78 
 
 		 275 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  36.96 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  37.78 
 
 		 275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  42.63 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  36.96 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  42.86 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  34.55 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  39.01 
 
 		 300 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  36.96 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  37.91 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  40.74 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  43.21 
 
 		 319 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  43.21 
 
 		 321 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  41.62 
 
 		 296 aa  125  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  37.13 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  38.5 
 
 		 318 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  37.36 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37.13 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  54.47 
 
 		 141 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  37.13 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  41.49 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  45.83 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  40.79 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  45.45 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  33.61 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  43.85 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  38.5 
 
 		 312 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  39.07 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  36.96 
 
 		 306 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  39.87 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  34.73 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.63 
 
 		 293 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  30.73 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  37.71 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  38.07 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  36.04 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  40.99 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  39.88 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  33.47 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  44.26 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  32.78 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  44.53 
 
 		 302 aa  96.3  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  45.74 
 
 		 649 aa  95.9  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  39.34 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  40.82 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  45.45 
 
 		 400 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  45.45 
 
 		 420 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  45.45 
 
 		 412 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  44.7 
 
 		 425 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  45.45 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  44.7 
 
 		 425 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  45.45 
 
 		 421 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  36.62 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  30.08 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  36.62 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  36.62 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  44.63 
 
 		 331 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.26 
 
 		 375 aa  92  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>