More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1066 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  98.91 
 
 
275 aa  550  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  97.09 
 
 
275 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  94.18 
 
 
275 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  85.38 
 
 
273 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  78.26 
 
 
274 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  77.9 
 
 
274 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  72.98 
 
 
282 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  72.63 
 
 
282 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  70.08 
 
 
280 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  70.52 
 
 
274 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  51.21 
 
 
271 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  50.81 
 
 
263 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  50 
 
 
296 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  48.18 
 
 
296 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  48.37 
 
 
322 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  48.37 
 
 
316 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  45.64 
 
 
272 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  45.53 
 
 
290 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  45.87 
 
 
277 aa  219  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  45.74 
 
 
289 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  36.98 
 
 
300 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  36.59 
 
 
300 aa  188  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  39.01 
 
 
313 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  55.4 
 
 
141 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  40.28 
 
 
336 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  45.24 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  39.17 
 
 
336 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  40.56 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  37.33 
 
 
282 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  41.24 
 
 
280 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  39.67 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  39.89 
 
 
278 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  33.8 
 
 
273 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  40 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  34.26 
 
 
244 aa  135  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  39.46 
 
 
306 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  33.74 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  37.78 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  40 
 
 
276 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  31.45 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
266 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  37.78 
 
 
272 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  37.02 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  34.64 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  42.17 
 
 
299 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  38.92 
 
 
317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  35.8 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  37.29 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  27.89 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  35.33 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.5 
 
 
293 aa  126  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  31.69 
 
 
318 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  34.31 
 
 
283 aa  125  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  31.28 
 
 
321 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  31.28 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  31.92 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  38.04 
 
 
232 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  35.91 
 
 
280 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.22 
 
 
305 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  34.78 
 
 
287 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  37.68 
 
 
312 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  35.91 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  34.81 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  35.36 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  35.36 
 
 
313 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  29.88 
 
 
285 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  33.52 
 
 
282 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  35.91 
 
 
301 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  35.59 
 
 
302 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  35.36 
 
 
306 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  34.25 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  34.81 
 
 
312 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  30.82 
 
 
294 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36.2 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  33.52 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  34.81 
 
 
311 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  45.16 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  30.37 
 
 
282 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  41.6 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.72 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  32.74 
 
 
312 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.25 
 
 
321 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36.51 
 
 
453 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  39.73 
 
 
305 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.04 
 
 
305 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.04 
 
 
305 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35 
 
 
301 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  29.24 
 
 
286 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  31.47 
 
 
300 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  37.66 
 
 
375 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  37.89 
 
 
395 aa  105  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  38.5 
 
 
455 aa  105  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  39.04 
 
 
305 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  40.16 
 
 
248 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  36.1 
 
 
454 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.73 
 
 
411 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  37.5 
 
 
300 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.78 
 
 
304 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  35.76 
 
 
309 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>