More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0622 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  100 
 
 		 280 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  45.79 
 
 		 287 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  45.88 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  47.49 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  45.68 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  44.65 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  45.32 
 
 		 287 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  45.28 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  45.7 
 
 		 313 aa  238  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  41.76 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  45.38 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  43.91 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  43.91 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  41.91 
 
 		 280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  45.45 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  42.12 
 
 		 311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  45.1 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  44.71 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  44.71 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  45.38 
 
 		 269 aa  229  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  46.78 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  46.81 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  46.81 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  46.85 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  45.93 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  50.92 
 
 		 232 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  39.5 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.16 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  44.58 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  40.71 
 
 		 284 aa  168  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  45.86 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  39.11 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  43.39 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  40.37 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  38.29 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  44 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  43.43 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  41.24 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  41.81 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  41.24 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  41.24 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  40.1 
 
 		 273 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  42.86 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  43.02 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  39.34 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  40.98 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  41.81 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  39.06 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  40.62 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  40.62 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  39.77 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  39.9 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  32.32 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  34.24 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  37.68 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  37.11 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  34.55 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  40.99 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  40.33 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  47.62 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  40.37 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  42.41 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  37.76 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  37.56 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  42.51 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.21 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  32.5 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  42.6 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  34.4 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  33.16 
 
 		 244 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  31.61 
 
 		 255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  35.94 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  46.34 
 
 		 141 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  30.89 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  41.67 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  40.78 
 
 		 317 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  46.61 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  50.41 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  28.64 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  38.12 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  38.52 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  31.74 
 
 		 498 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  30.98 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  37.16 
 
 		 441 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  41.13 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.84 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  40 
 
 		 431 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.9 
 
 		 376 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.52 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  39.52 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  40.83 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.52 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  42.98 
 
 		 402 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50.93 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  34.97 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  39.52 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  38.58 
 
 		 418 aa  93.6  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  40.82 
 
 		 325 aa  92.8  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  36.02 
 
 		 445 aa  92.4  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>