More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3453 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  100 
 
 		 271 aa  550  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  51.61 
 
 		 275 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  51.61 
 
 		 275 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  51.21 
 
 		 275 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  50 
 
 		 282 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  50.93 
 
 		 274 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  51.61 
 
 		 275 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  49.61 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  49.81 
 
 		 274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  49.24 
 
 		 282 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  50.61 
 
 		 274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  48.26 
 
 		 273 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  50 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  46.31 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  48 
 
 		 263 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  47.6 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  49.8 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  47.81 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  43.45 
 
 		 300 aa  216  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  42.32 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  45.85 
 
 		 296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  45.9 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  45.58 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  46.12 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  43.61 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  45.11 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  61.98 
 
 		 141 aa  162  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  42.13 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  38.65 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  43.5 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  43.5 
 
 		 272 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  39.71 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  35.69 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  35.63 
 
 		 319 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  36.19 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.97 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  35.22 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  39.44 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  33.33 
 
 		 328 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  40 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  40.93 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  38.53 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  39.7 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  38.33 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  36 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  37.13 
 
 		 285 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  40.57 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  40.98 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.83 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  40.34 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  38.82 
 
 		 287 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  40.09 
 
 		 232 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  36.11 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  38.66 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  36.02 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  35.62 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  34.35 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  35.23 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  50.39 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  33.74 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  37.71 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  35.77 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  38.33 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  45.58 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  37.78 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  36.67 
 
 		 313 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  33.2 
 
 		 302 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  38.51 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  44.9 
 
 		 312 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  37.78 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37.85 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  37.22 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  45.58 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  37.93 
 
 		 244 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  36.72 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  36.67 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  34.39 
 
 		 306 aa  122  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  35 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  32.27 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  40.94 
 
 		 395 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  35.06 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  44.26 
 
 		 303 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.59 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.11 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.74 
 
 		 375 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  35.47 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.72 
 
 		 411 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.41 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  34.76 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40.24 
 
 		 454 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  47.06 
 
 		 313 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  38.29 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  37.16 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  38.41 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  37.84 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  37.84 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  48.8 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39.75 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  31.23 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  37.84 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>