More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2737 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  100 
 
 
281 aa  559  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  86.99 
 
 
279 aa  437  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  68.79 
 
 
285 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  70.3 
 
 
272 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  46.15 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  49.59 
 
 
282 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  44.72 
 
 
306 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  45.12 
 
 
301 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  48.95 
 
 
276 aa  238  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  47.54 
 
 
302 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  43.65 
 
 
286 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  47.92 
 
 
269 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  44.31 
 
 
306 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  49.17 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  43.25 
 
 
282 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  44.94 
 
 
287 aa  232  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  43.95 
 
 
312 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  45.04 
 
 
311 aa  231  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  42.86 
 
 
287 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  43.15 
 
 
287 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  40.64 
 
 
312 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  44.73 
 
 
280 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  43.09 
 
 
282 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  46.12 
 
 
280 aa  221  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  42.74 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  44.31 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.56 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  44.44 
 
 
232 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  43.8 
 
 
303 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  40.7 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  38.65 
 
 
282 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  38.3 
 
 
282 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  50 
 
 
312 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  41.92 
 
 
274 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  42.13 
 
 
282 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  38.53 
 
 
271 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  41.25 
 
 
284 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  41.41 
 
 
274 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  46.6 
 
 
322 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  39.57 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  39.57 
 
 
275 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  39.04 
 
 
275 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  38.22 
 
 
273 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  41.09 
 
 
272 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  38.92 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  42.37 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  41.08 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  42.37 
 
 
300 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  36.86 
 
 
328 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37.78 
 
 
266 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  37.04 
 
 
255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  36.6 
 
 
291 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  36.67 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  36.67 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  33.21 
 
 
313 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  32.98 
 
 
268 aa  132  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  42.93 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  42.56 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  46.95 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  40.65 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  41.71 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  36.22 
 
 
285 aa  128  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  42.58 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  41.57 
 
 
336 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  39.67 
 
 
277 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  40.5 
 
 
289 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  55.74 
 
 
141 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  40.24 
 
 
318 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  41.61 
 
 
319 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  41.61 
 
 
321 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  40.44 
 
 
336 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  32.28 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.89 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  42.57 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  36.5 
 
 
306 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  37.93 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  30.57 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  38.3 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  33.18 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  40.31 
 
 
395 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  41.61 
 
 
305 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  41.61 
 
 
305 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  41.61 
 
 
305 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.09 
 
 
301 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  35.15 
 
 
294 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  44.96 
 
 
283 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  39.23 
 
 
494 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  34.83 
 
 
301 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  39.84 
 
 
537 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  40 
 
 
501 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  46.46 
 
 
302 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  37.57 
 
 
265 aa  97.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  31.3 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  41.61 
 
 
320 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  39.37 
 
 
451 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  39.37 
 
 
455 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  38.65 
 
 
469 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  42.52 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  40.15 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  40.16 
 
 
446 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>