More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2615 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
288 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  51.87 
 
 
306 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  51.33 
 
 
311 aa  278  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  48.95 
 
 
301 aa  278  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  48.25 
 
 
306 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  49.64 
 
 
312 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  53.04 
 
 
312 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  51.82 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  51.33 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  48.52 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  52.23 
 
 
287 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  53.06 
 
 
282 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  49.04 
 
 
313 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  49.63 
 
 
282 aa  268  7e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  50.19 
 
 
280 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  52.48 
 
 
282 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  53.25 
 
 
269 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  47.97 
 
 
302 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  45.16 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  44 
 
 
276 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.15 
 
 
305 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  43.88 
 
 
279 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  38.16 
 
 
285 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  42.08 
 
 
272 aa  202  7e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  39.5 
 
 
280 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  42.74 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  37.15 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  36.36 
 
 
232 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  36.67 
 
 
299 aa  159  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  35.12 
 
 
284 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  33.06 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  34.22 
 
 
282 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  40.57 
 
 
271 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  38.51 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  36.04 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  38.64 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  38.2 
 
 
300 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  37.85 
 
 
275 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  37.08 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  37.29 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  35.03 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  37.29 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  36.72 
 
 
275 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  27.95 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  35.52 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  33.15 
 
 
313 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  34.46 
 
 
273 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  36.31 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  40.4 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  32.99 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  32.53 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  35.11 
 
 
322 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.18 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  29.83 
 
 
328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  36 
 
 
296 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  36 
 
 
263 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  31.55 
 
 
336 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  34.13 
 
 
336 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  44.26 
 
 
316 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  44.26 
 
 
141 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  36.7 
 
 
312 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  33.53 
 
 
317 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  32.16 
 
 
269 aa  104  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  42.62 
 
 
296 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  37.82 
 
 
285 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  27.16 
 
 
299 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  32.53 
 
 
285 aa  100  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  32.54 
 
 
285 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  39.57 
 
 
289 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  36.18 
 
 
321 aa  98.6  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  36.18 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  31.03 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  35.53 
 
 
318 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  31.71 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  28.8 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  31 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  33.11 
 
 
286 aa  93.2  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  33.7 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  37.39 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31.03 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  33.82 
 
 
395 aa  90.9  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.54 
 
 
244 aa  89.4  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  30.05 
 
 
273 aa  89  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  34.57 
 
 
332 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  38.33 
 
 
300 aa  87  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  35.53 
 
 
283 aa  87  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  35.77 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2189  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.28 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  34.52 
 
 
247 aa  85.5  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  33.75 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  36.67 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  36.67 
 
 
305 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  32.07 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.52 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  36.67 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  44.44 
 
 
507 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  37.5 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  37.5 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  28.88 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35.21 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>