More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2406 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  100 
 
 		 283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  39.92 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.92 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  33.77 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  36.51 
 
 		 430 aa  162  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  33.33 
 
 		 363 aa  153  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  35.66 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  39.48 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  33.62 
 
 		 419 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  32.87 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  34.12 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  31.14 
 
 		 328 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  37.04 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  33.74 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  35.54 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  36.36 
 
 		 294 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  34.18 
 
 		 475 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  40.5 
 
 		 360 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  30.98 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  34.15 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  33.86 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  31.56 
 
 		 412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  36.33 
 
 		 602 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  34.8 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  32.48 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  43.14 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  30.94 
 
 		 482 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  33.69 
 
 		 349 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  34.82 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  31.07 
 
 		 394 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  30.6 
 
 		 468 aa  126  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  34.73 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  29.92 
 
 		 582 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  31.18 
 
 		 452 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  47.24 
 
 		 404 aa  122  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  30.04 
 
 		 278 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  32.65 
 
 		 402 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  34.06 
 
 		 450 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  48.31 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  46.72 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.53 
 
 		 375 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  47.46 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  47.86 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  36.31 
 
 		 400 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0826  Peptidase M23  34.47 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0798  Peptidase M23  34.47 
 
 		 281 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  44.53 
 
 		 411 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  45.08 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  32.23 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  45.83 
 
 		 751 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  32.56 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  45.76 
 
 		 590 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  28.45 
 
 		 478 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  32.85 
 
 		 468 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  46.51 
 
 		 402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  29.29 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  30.25 
 
 		 474 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  39.64 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  43.9 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.26 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  44.92 
 
 		 754 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  30.67 
 
 		 464 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  45.76 
 
 		 198 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  45.76 
 
 		 198 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  30.61 
 
 		 427 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  39.05 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  31.09 
 
 		 484 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  30.04 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.71 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  30.61 
 
 		 427 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  42.74 
 
 		 456 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  42.98 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  43.55 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  44.17 
 
 		 824 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  41.8 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  37.93 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  42.74 
 
 		 459 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  43.55 
 
 		 453 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  39.86 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.86 
 
 		 399 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  38.19 
 
 		 404 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.32 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  43.2 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  38.36 
 
 		 446 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  41.13 
 
 		 372 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.1 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  47.06 
 
 		 323 aa  105  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  40.94 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  41.8 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  40.94 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  40.94 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  32.07 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  37.7 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  29.6 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  41.94 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  45.9 
 
 		 414 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  44.64 
 
 		 350 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  31.2 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  39.83 
 
 		 316 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.62 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>