More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2008 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  100 
 
 		 602 aa  1190    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  26.8 
 
 		 509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  36.33 
 
 		 283 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  30.38 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.46 
 
 		 1001 aa  127  6e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  24.23 
 
 		 633 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  27.52 
 
 		 430 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.79 
 
 		 274 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  30.61 
 
 		 293 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3059  peptidase M23B  32.1 
 
 		 318 aa  122  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.430429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  29.75 
 
 		 328 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  24.75 
 
 		 590 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  31.29 
 
 		 310 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  29.11 
 
 		 1021 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  30.89 
 
 		 290 aa  117  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  33.06 
 
 		 312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  33.33 
 
 		 320 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  32.81 
 
 		 271 aa  114  6e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  30.36 
 
 		 484 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  33.2 
 
 		 271 aa  113  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  32.38 
 
 		 301 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  34.27 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  41.27 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  33.33 
 
 		 311 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  32.89 
 
 		 292 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  29.67 
 
 		 314 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  30.19 
 
 		 309 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  31.4 
 
 		 271 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  31.88 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  27.25 
 
 		 409 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  28.23 
 
 		 285 aa  108  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  30.57 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  27.27 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  30.57 
 
 		 296 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  31.69 
 
 		 294 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  29.88 
 
 		 262 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  32.68 
 
 		 230 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  30.86 
 
 		 295 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  29.88 
 
 		 262 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  28.84 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  24.69 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  31.75 
 
 		 238 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  27.07 
 
 		 620 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  25.66 
 
 		 751 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  32.68 
 
 		 230 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  27.74 
 
 		 288 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  30.65 
 
 		 377 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  32.03 
 
 		 324 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  31.63 
 
 		 275 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  30.86 
 
 		 299 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  29.84 
 
 		 288 aa  104  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  29.75 
 
 		 285 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  29.18 
 
 		 284 aa  103  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  33.01 
 
 		 248 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65030  hypothetical protein  36.63 
 
 		 231 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.195389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  29.79 
 
 		 296 aa  103  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  31.18 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  31.18 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  29.1 
 
 		 311 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  33.33 
 
 		 230 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  31.18 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  32.54 
 
 		 236 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  30.53 
 
 		 294 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  32.82 
 
 		 230 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  36.07 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  33.17 
 
 		 360 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  31.18 
 
 		 377 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  30.39 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  28.46 
 
 		 317 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1853  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.17 
 
 		 568 aa  102  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000056221  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  28.12 
 
 		 298 aa  101  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  35.25 
 
 		 471 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  29.63 
 
 		 304 aa  101  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5650  hypothetical protein  33.82 
 
 		 231 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  28.81 
 
 		 292 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  27.86 
 
 		 284 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  29.63 
 
 		 298 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1920  peptidase M23B  28.25 
 
 		 315 aa  100  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123446 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  30.54 
 
 		 250 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  39.17 
 
 		 494 aa  100  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  30.7 
 
 		 268 aa  100  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  30.54 
 
 		 250 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  36.36 
 
 		 449 aa  99.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  26.88 
 
 		 412 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  30.54 
 
 		 250 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  45.08 
 
 		 296 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  35.62 
 
 		 499 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  45.08 
 
 		 298 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  30.37 
 
 		 274 aa  99  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  45.08 
 
 		 292 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  45.08 
 
 		 296 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  26.19 
 
 		 401 aa  99.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  30.28 
 
 		 546 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  30.77 
 
 		 260 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  33.88 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  45.08 
 
 		 296 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  32.38 
 
 		 250 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  45.08 
 
 		 296 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  25.4 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  45.08 
 
 		 296 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>