More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3131 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  99.73 
 
 		 377 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  100 
 
 		 377 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  100 
 
 		 377 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  100 
 
 		 377 aa  763    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  99.73 
 
 		 377 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  84.62 
 
 		 363 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  85 
 
 		 379 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  85 
 
 		 379 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  85 
 
 		 379 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  85 
 
 		 379 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  85 
 
 		 379 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  79.63 
 
 		 374 aa  591  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  84.74 
 
 		 379 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  84.74 
 
 		 379 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  84.08 
 
 		 363 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  58.99 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  58.73 
 
 		 327 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  58.73 
 
 		 327 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  56.4 
 
 		 345 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  52.91 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  57.07 
 
 		 344 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0840  Peptidase M23  50 
 
 		 404 aa  359  4e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  68.68 
 
 		 328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  50.55 
 
 		 290 aa  253  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  44.69 
 
 		 249 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  48.06 
 
 		 311 aa  239  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  46.95 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  46.69 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  44.32 
 
 		 289 aa  222  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  45.72 
 
 		 296 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  42.6 
 
 		 272 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  45.32 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  43.77 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  43.77 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  43.8 
 
 		 310 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  46.07 
 
 		 304 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  42.96 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  45.25 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  43.59 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2507  lipoprotein  43.55 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  44.15 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  44.87 
 
 		 298 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  42.65 
 
 		 298 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  40.26 
 
 		 311 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  45.63 
 
 		 298 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  44.49 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  35.79 
 
 		 285 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  43.4 
 
 		 251 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  43.4 
 
 		 251 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  43.4 
 
 		 251 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  43.4 
 
 		 251 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  43.4 
 
 		 251 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  43.94 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  43.7 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  71.09 
 
 		 307 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  42.14 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  43.61 
 
 		 250 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  43.61 
 
 		 250 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  43.61 
 
 		 250 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  43.23 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  38.46 
 
 		 367 aa  193  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  43.28 
 
 		 262 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  42.44 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  43.08 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  41.09 
 
 		 261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  39.92 
 
 		 257 aa  190  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  41.58 
 
 		 262 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  41.63 
 
 		 284 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  42.69 
 
 		 288 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  43.02 
 
 		 288 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  38.85 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  58.33 
 
 		 250 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  40.68 
 
 		 285 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  57.82 
 
 		 250 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  58.04 
 
 		 251 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  58.04 
 
 		 251 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  58.04 
 
 		 251 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  63.87 
 
 		 248 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  38.91 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  41.25 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  38.32 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  36.5 
 
 		 260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  39.69 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  40.08 
 
 		 287 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  37.4 
 
 		 309 aa  166  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  38.89 
 
 		 360 aa  166  9e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  40.78 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  38.85 
 
 		 246 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1799  Peptidase M23  39.38 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  40.47 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  40.47 
 
 		 295 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  38.85 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  39.85 
 
 		 292 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  39.61 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  39.53 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  38.82 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  38.08 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  37.65 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  59.17 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  38.82 
 
 		 270 aa  156  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>