More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14641 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  100 
 
 
360 aa  730    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  41.6 
 
 
358 aa  278  9e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  46.53 
 
 
333 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  43.38 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  65.04 
 
 
754 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  57.24 
 
 
590 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  61.11 
 
 
824 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  62.6 
 
 
751 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  54.3 
 
 
727 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  54.3 
 
 
727 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  47.51 
 
 
195 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  61.29 
 
 
788 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  36.88 
 
 
452 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  55.73 
 
 
198 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  54.96 
 
 
198 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  56.91 
 
 
511 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  37.14 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  37.34 
 
 
283 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  49.18 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  49.15 
 
 
482 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  39.42 
 
 
230 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  48.8 
 
 
348 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  34.69 
 
 
274 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  33.78 
 
 
271 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  33.78 
 
 
271 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  35.45 
 
 
271 aa  119  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.2 
 
 
411 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  32.9 
 
 
278 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  49.15 
 
 
582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  47.62 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  46.72 
 
 
332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  47.62 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  44.2 
 
 
491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  47.62 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  44.8 
 
 
334 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  48 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  46.51 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  36.99 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  48.03 
 
 
309 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  37.44 
 
 
430 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  35.17 
 
 
265 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  30.2 
 
 
412 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  50.85 
 
 
284 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  50 
 
 
294 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  45.97 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  49.15 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  47.5 
 
 
305 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  45.22 
 
 
339 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  50 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  50 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  44.35 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  48.06 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  31.16 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  50 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  29.77 
 
 
363 aa  110  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  45.16 
 
 
305 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  46.15 
 
 
318 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  45.22 
 
 
339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  47.5 
 
 
296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.39 
 
 
326 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  35.58 
 
 
324 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  42.86 
 
 
299 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  45 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  45.54 
 
 
199 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  46.15 
 
 
313 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  45.83 
 
 
320 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  41.61 
 
 
299 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  46.49 
 
 
406 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  42.97 
 
 
305 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.28 
 
 
402 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  46.09 
 
 
340 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  42.24 
 
 
299 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  47.46 
 
 
468 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  48.36 
 
 
332 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  44.63 
 
 
288 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  50 
 
 
300 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  42.45 
 
 
404 aa  107  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45.97 
 
 
298 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  44.19 
 
 
367 aa  106  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  42.24 
 
 
299 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  47.62 
 
 
458 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  43.85 
 
 
319 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  27.44 
 
 
475 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  42.86 
 
 
299 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  28.57 
 
 
320 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  33.48 
 
 
375 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  42.97 
 
 
400 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  45.6 
 
 
388 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  43.55 
 
 
305 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  30.95 
 
 
402 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  43.55 
 
 
305 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  39.87 
 
 
282 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  42.74 
 
 
305 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  52.53 
 
 
448 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  44.63 
 
 
298 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  32.6 
 
 
602 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  44.35 
 
 
340 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  44.72 
 
 
224 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  49.14 
 
 
285 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  44.35 
 
 
340 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>