More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5120 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  100 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  60 
 
 		 326 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  72.66 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  59.88 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  56.6 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  57.23 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  55.97 
 
 		 340 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  55.97 
 
 		 340 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  56.05 
 
 		 339 aa  182  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  58.99 
 
 		 245 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  55.9 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  55.9 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  55.9 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  48.66 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  53.46 
 
 		 348 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  63.33 
 
 		 348 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  61.98 
 
 		 199 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  53.15 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  62.02 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  61.54 
 
 		 320 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  47.8 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  46.15 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  51.63 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  55.47 
 
 		 458 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  56.8 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  56.8 
 
 		 311 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  54.4 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  49.65 
 
 		 346 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  49.59 
 
 		 727 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  49.59 
 
 		 727 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  51.2 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.74 
 
 		 751 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  46.72 
 
 		 590 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  47.93 
 
 		 198 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  47.93 
 
 		 198 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  49.58 
 
 		 452 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 754 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  37.7 
 
 		 349 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  47.5 
 
 		 824 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  49.59 
 
 		 511 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  50.42 
 
 		 195 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  44.03 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  41.72 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  48 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  48.65 
 
 		 491 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  46.61 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  39.04 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  48.82 
 
 		 466 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  44.63 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  38.12 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  38.89 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  43.07 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.29 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  48.72 
 
 		 788 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  44.44 
 
 		 447 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  44.44 
 
 		 447 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.95 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  43.33 
 
 		 419 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  39.2 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  42.86 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  44.83 
 
 		 699 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  42.24 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  44.83 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  38.32 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  43.97 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  44.83 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  36.9 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  45.13 
 
 		 448 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  44.14 
 
 		 697 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  45.32 
 
 		 697 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5760  peptidase M23B  35.68 
 
 		 443 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3571  M23 peptidase domain protein  44.03 
 
 		 441 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  45.76 
 
 		 445 aa  98.2  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  38.71 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  42.62 
 
 		 367 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  45.9 
 
 		 352 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  39.57 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  39.66 
 
 		 482 aa  96.7  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  44.53 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  43.55 
 
 		 394 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  33.33 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  37.65 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  48.6 
 
 		 402 aa  95.9  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  37.09 
 
 		 237 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  41.6 
 
 		 524 aa  95.5  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  43.55 
 
 		 328 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  41.6 
 
 		 441 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  43.44 
 
 		 333 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  38.41 
 
 		 564 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.6 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  41.94 
 
 		 431 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  47.15 
 
 		 539 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  42.86 
 
 		 527 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  45.38 
 
 		 665 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  43.22 
 
 		 238 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  45.76 
 
 		 538 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  42.86 
 
 		 681 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  42.37 
 
 		 243 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  42.86 
 
 		 414 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  42.86 
 
 		 676 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>