More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1678 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  100 
 
 
285 aa  584  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  49.46 
 
 
273 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  46.31 
 
 
252 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  44.35 
 
 
240 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  44.07 
 
 
247 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  40 
 
 
241 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  40.98 
 
 
247 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  60.53 
 
 
251 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  46.27 
 
 
369 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  46.27 
 
 
319 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  54.78 
 
 
199 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  40.62 
 
 
313 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.05 
 
 
321 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  45.86 
 
 
318 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  55.45 
 
 
184 aa  123  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  56.64 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  56.36 
 
 
186 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  54.81 
 
 
274 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.3 
 
 
243 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  53.91 
 
 
186 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  42.59 
 
 
379 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  49.56 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  42.95 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  46.88 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  58.88 
 
 
727 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  57.01 
 
 
751 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  58.88 
 
 
727 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  47.85 
 
 
195 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  45.38 
 
 
318 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  46.28 
 
 
314 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  49.58 
 
 
324 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  45.38 
 
 
315 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  44.44 
 
 
379 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  52.94 
 
 
192 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  56.57 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  43.84 
 
 
590 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  43.75 
 
 
445 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  36.91 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  47.2 
 
 
367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  55.56 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  52.29 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  46.46 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  40.38 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  44.09 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.73 
 
 
298 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  41.01 
 
 
376 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  39.86 
 
 
216 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  44.62 
 
 
305 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  37.79 
 
 
319 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  45.38 
 
 
305 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  42.34 
 
 
316 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.86 
 
 
282 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.7 
 
 
238 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.7 
 
 
238 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  38.92 
 
 
384 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  37.5 
 
 
310 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  53.33 
 
 
824 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  39.49 
 
 
541 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  44.92 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  42.25 
 
 
290 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  49.57 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  55.56 
 
 
291 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  41.98 
 
 
274 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  46.15 
 
 
439 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  40.6 
 
 
313 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  51.33 
 
 
419 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  46.72 
 
 
375 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  43.7 
 
 
292 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  45.83 
 
 
394 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  43.7 
 
 
413 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  42.45 
 
 
340 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  55.56 
 
 
284 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  44.83 
 
 
291 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  45.6 
 
 
332 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  49.11 
 
 
374 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  41.03 
 
 
656 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  43.75 
 
 
423 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  49.09 
 
 
293 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  53.15 
 
 
349 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  45.38 
 
 
388 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  39.49 
 
 
375 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  44.96 
 
 
605 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  46.92 
 
 
328 aa  106  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  45.38 
 
 
296 aa  106  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  45.45 
 
 
332 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  47.2 
 
 
333 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  44.07 
 
 
299 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  40.76 
 
 
308 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  41.54 
 
 
465 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  37.58 
 
 
301 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  46.96 
 
 
430 aa  105  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  39.13 
 
 
323 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  46.51 
 
 
524 aa  105  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  50 
 
 
194 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  44.62 
 
 
440 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  44.54 
 
 
299 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  44.54 
 
 
299 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  44.54 
 
 
299 aa  105  9e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  42.19 
 
 
450 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  42.75 
 
 
459 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>