More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2553 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  100 
 
 		 323 aa  659    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  34.44 
 
 		 325 aa  205  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.89 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  33.63 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  34.56 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  37.54 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  31.33 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.79 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  44.32 
 
 		 223 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  36.25 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  36.25 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  35.83 
 
 		 305 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35.42 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  34.1 
 
 		 282 aa  143  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  32.13 
 
 		 300 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  39.78 
 
 		 274 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  34.6 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  51.97 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  33.75 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  37.84 
 
 		 247 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  30.58 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.57 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  32.14 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  48.41 
 
 		 375 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  52.94 
 
 		 524 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  43.15 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  48.12 
 
 		 238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  48.53 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  34.96 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.2 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50.39 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  48 
 
 		 274 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  32.54 
 
 		 334 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  33.22 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  34.8 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  38.99 
 
 		 367 aa  119  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  44.44 
 
 		 233 aa  119  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  31.67 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  32.46 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.62 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  49.57 
 
 		 446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  45.65 
 
 		 569 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  48.72 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  48.72 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  51.22 
 
 		 582 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  45.97 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  49.12 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  42.4 
 
 		 271 aa  116  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  31.76 
 
 		 299 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  38.24 
 
 		 271 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  32.34 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  37.06 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  42.76 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  40.88 
 
 		 527 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  36.84 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  48.85 
 
 		 491 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  47.15 
 
 		 358 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  39.16 
 
 		 541 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  43.62 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  38.15 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  43.7 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  49.56 
 
 		 430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  41.81 
 
 		 419 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  40.83 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  39.47 
 
 		 265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  41.38 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  46.34 
 
 		 452 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  45.16 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.62 
 
 		 229 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  52.34 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  36.36 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  48.76 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  48.33 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.75 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  38.86 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  36.93 
 
 		 375 aa  109  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  47.9 
 
 		 238 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  44.72 
 
 		 676 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  39.64 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  44.74 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  29.15 
 
 		 340 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  42.55 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  34.31 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  51.24 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  32.49 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  51.24 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  33.58 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  46.03 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  51.24 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.15 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  44.6 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  48.78 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  48.78 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  40.88 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.28 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  51.24 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  51.24 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  44.72 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  43.2 
 
 		 687 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  42.86 
 
 		 690 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>