More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1181 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  100 
 
 
241 aa  490  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  91.29 
 
 
247 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  53.68 
 
 
247 aa  238  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  45.49 
 
 
252 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  40 
 
 
240 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  40.94 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  40 
 
 
285 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  53.39 
 
 
238 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  51.28 
 
 
369 aa  124  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  52.54 
 
 
238 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  50.43 
 
 
319 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.55 
 
 
243 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  51.72 
 
 
313 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  50.43 
 
 
301 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  47.73 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  51.38 
 
 
541 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  48.82 
 
 
186 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  52.85 
 
 
184 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  48.78 
 
 
192 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  48.82 
 
 
186 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  42.86 
 
 
452 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  48.39 
 
 
198 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  51.61 
 
 
251 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  50.46 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  51.38 
 
 
388 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.26 
 
 
298 aa  111  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  50 
 
 
310 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  42.52 
 
 
430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  49.54 
 
 
318 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  48.62 
 
 
610 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  47.15 
 
 
309 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  50.89 
 
 
199 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46.43 
 
 
411 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  47.66 
 
 
391 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  46.02 
 
 
315 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.97 
 
 
321 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  43.97 
 
 
324 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  41.41 
 
 
300 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  41.67 
 
 
303 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  47.5 
 
 
605 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  42.07 
 
 
351 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  48.31 
 
 
394 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.6 
 
 
303 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  46.09 
 
 
392 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  46.79 
 
 
377 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  47.79 
 
 
299 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  45.31 
 
 
392 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  39.13 
 
 
223 aa  105  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  46.67 
 
 
332 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  43.2 
 
 
440 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  50 
 
 
582 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  45.95 
 
 
314 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  45.38 
 
 
332 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.25 
 
 
375 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  45.69 
 
 
375 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  49.56 
 
 
751 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  46.15 
 
 
328 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  42.4 
 
 
439 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  49.12 
 
 
194 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  40.24 
 
 
348 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  47.32 
 
 
419 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  42.95 
 
 
195 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  46.43 
 
 
399 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  43.41 
 
 
456 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  49.57 
 
 
379 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.45 
 
 
248 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  43.41 
 
 
455 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  44.26 
 
 
299 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  49.56 
 
 
590 aa  102  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  44.74 
 
 
376 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  35.62 
 
 
265 aa  102  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.09 
 
 
423 aa  101  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.19 
 
 
453 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  48.67 
 
 
727 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  45.13 
 
 
417 aa  101  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  45.24 
 
 
414 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  45.54 
 
 
399 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  40.35 
 
 
295 aa  101  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  48.67 
 
 
727 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  43.7 
 
 
299 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  43.75 
 
 
363 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  43.7 
 
 
296 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  48.15 
 
 
216 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  44.83 
 
 
299 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  43.97 
 
 
299 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  43.41 
 
 
524 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  48.21 
 
 
468 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  50.85 
 
 
374 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  43.86 
 
 
305 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  50.49 
 
 
231 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  42.22 
 
 
442 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  46.15 
 
 
316 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  35.81 
 
 
274 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  44.86 
 
 
375 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  47.62 
 
 
367 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  37.5 
 
 
305 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  45.37 
 
 
352 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  43.28 
 
 
455 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  48.15 
 
 
294 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  47.22 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>