More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3645 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  60.34 
 
 
186 aa  216  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  60 
 
 
186 aa  214  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  54.65 
 
 
192 aa  167  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  46.93 
 
 
198 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  58.2 
 
 
251 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  45.73 
 
 
199 aa  148  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  46.67 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  58.18 
 
 
273 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  55.45 
 
 
285 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  55.08 
 
 
301 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  56.36 
 
 
247 aa  121  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  52.03 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  52.85 
 
 
241 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  50.43 
 
 
274 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  46.88 
 
 
334 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  52.99 
 
 
252 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  49.14 
 
 
314 aa  111  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  51.89 
 
 
430 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  51.43 
 
 
388 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  47.62 
 
 
610 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  51.43 
 
 
367 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  50 
 
 
605 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  49.14 
 
 
299 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  47.32 
 
 
318 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  47.86 
 
 
299 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  46.43 
 
 
313 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.57 
 
 
411 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  53.76 
 
 
419 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.61 
 
 
304 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  47.62 
 
 
375 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  50.49 
 
 
529 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  51.46 
 
 
216 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  49.55 
 
 
292 aa  102  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  47.32 
 
 
404 aa  101  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  42.86 
 
 
243 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  48.48 
 
 
431 aa  100  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  42.54 
 
 
238 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.64 
 
 
303 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  47.01 
 
 
299 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  48 
 
 
441 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  47.01 
 
 
299 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  46.15 
 
 
299 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  47.32 
 
 
369 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  50 
 
 
400 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  49.12 
 
 
240 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  47.32 
 
 
319 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  41.54 
 
 
387 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  39.49 
 
 
238 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  50.46 
 
 
299 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.72 
 
 
377 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  46.67 
 
 
282 aa  99.4  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  43.81 
 
 
363 aa  98.6  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  46.15 
 
 
299 aa  98.6  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  45.22 
 
 
308 aa  99  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  48.62 
 
 
590 aa  99  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  45.71 
 
 
324 aa  99  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  39.41 
 
 
293 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  48.57 
 
 
265 aa  98.2  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  48.11 
 
 
358 aa  98.2  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  46.09 
 
 
315 aa  97.8  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  46.96 
 
 
305 aa  98.2  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  47.57 
 
 
523 aa  97.8  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  41.67 
 
 
317 aa  97.8  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.06 
 
 
321 aa  97.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  45 
 
 
299 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  47.62 
 
 
443 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  45 
 
 
299 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  45 
 
 
299 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  45 
 
 
299 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.44 
 
 
298 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.11 
 
 
751 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  48.62 
 
 
299 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  47.71 
 
 
313 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  44.17 
 
 
299 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  44.17 
 
 
299 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  44.17 
 
 
299 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  50 
 
 
455 aa  95.9  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  42.34 
 
 
318 aa  95.9  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  50.54 
 
 
491 aa  95.9  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  44.17 
 
 
299 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  48.57 
 
 
360 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  44.17 
 
 
299 aa  95.9  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  45.13 
 
 
320 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  47.06 
 
 
316 aa  95.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  47.17 
 
 
468 aa  95.5  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  45.31 
 
 
442 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  46.23 
 
 
223 aa  95.1  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  42.06 
 
 
323 aa  94.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  44.74 
 
 
333 aa  94.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  48.45 
 
 
352 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  46.79 
 
 
417 aa  94.7  7e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  41.96 
 
 
305 aa  94.7  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  37.7 
 
 
295 aa  94.4  8e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  47.17 
 
 
824 aa  94.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  44.34 
 
 
402 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  48.6 
 
 
323 aa  93.6  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  50.52 
 
 
284 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  41.51 
 
 
300 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  40.17 
 
 
414 aa  94  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>