More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0598 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 590 aa  1170    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.23 
 
 		 751 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  64.77 
 
 		 824 aa  247  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  65.09 
 
 		 727 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  65.09 
 
 		 727 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  34.4 
 
 		 754 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  72 
 
 		 195 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  61.71 
 
 		 788 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  69.85 
 
 		 511 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  60.54 
 
 		 198 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  59.86 
 
 		 198 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  35.28 
 
 		 333 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  37.38 
 
 		 360 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  55.63 
 
 		 358 aa  169  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  57.94 
 
 		 349 aa  164  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  59.5 
 
 		 333 aa  154  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  55.28 
 
 		 348 aa  150  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  52.85 
 
 		 351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  52.71 
 
 		 274 aa  143  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  53.28 
 
 		 452 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  51.15 
 
 		 482 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  35.33 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  51.22 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  51.22 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  51.22 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  52.94 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  53.66 
 
 		 334 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  53.6 
 
 		 582 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  33.02 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  31.8 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  56.2 
 
 		 230 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  48.78 
 
 		 339 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  48.32 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  50.82 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  50 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  50.91 
 
 		 491 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  49.59 
 
 		 339 aa  126  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  50.41 
 
 		 332 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  52.38 
 
 		 414 aa  126  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  53.78 
 
 		 294 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  30.7 
 
 		 445 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  52.94 
 
 		 292 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  49.21 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  50.39 
 
 		 324 aa  125  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  53.78 
 
 		 291 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  48.78 
 
 		 340 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  47.97 
 
 		 340 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  47.97 
 
 		 340 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  30.92 
 
 		 394 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  52.94 
 
 		 284 aa  123  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  51.67 
 
 		 443 aa  123  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  24.5 
 
 		 602 aa  123  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  53.66 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  46.72 
 
 		 288 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  51.24 
 
 		 406 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.59 
 
 		 235 aa  121  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  31.72 
 
 		 448 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.18 
 
 		 411 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  32.69 
 
 		 305 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  47.5 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  48.12 
 
 		 376 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.83 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  47.58 
 
 		 224 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  48.84 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  32.71 
 
 		 265 aa  117  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  30.77 
 
 		 363 aa  117  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  50 
 
 		 524 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  49.61 
 
 		 271 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  29.86 
 
 		 401 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  45.93 
 
 		 375 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  49.57 
 
 		 269 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  49.23 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  48.06 
 
 		 309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  50 
 
 		 247 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  49.61 
 
 		 271 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  52.1 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  48.31 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  33.23 
 
 		 466 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  46.72 
 
 		 501 aa  115  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  52.43 
 
 		 430 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  49.57 
 
 		 251 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  48.74 
 
 		 646 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  47.9 
 
 		 446 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  45.76 
 
 		 283 aa  114  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  50.41 
 
 		 315 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  50 
 
 		 318 aa  114  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  46.72 
 
 		 537 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  50.85 
 
 		 569 aa  114  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  47.86 
 
 		 445 aa  113  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.58 
 
 		 301 aa  113  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  49.59 
 
 		 674 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  47.93 
 
 		 697 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  45.74 
 
 		 441 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  48.31 
 
 		 350 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  47.93 
 
 		 697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  31.61 
 
 		 304 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.62 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  30.94 
 
 		 374 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  50.85 
 
 		 457 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  47.11 
 
 		 699 aa  112  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>