More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2464 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  100 
 
 
231 aa  464  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  37.72 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  37.17 
 
 
236 aa  135  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  39.68 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  45.14 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  54.72 
 
 
453 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  47.2 
 
 
375 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  39.25 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40 
 
 
375 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  53.28 
 
 
541 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  51.69 
 
 
303 aa  118  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  45.59 
 
 
351 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  55.66 
 
 
456 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  40 
 
 
441 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  53.77 
 
 
455 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  51.88 
 
 
283 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  54.72 
 
 
459 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  47.93 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  45.39 
 
 
383 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  48.39 
 
 
375 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  43.67 
 
 
452 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  54.72 
 
 
457 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  55 
 
 
455 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  50.82 
 
 
414 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  53.33 
 
 
482 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  44.12 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  45.97 
 
 
379 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  46.03 
 
 
379 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  48.31 
 
 
300 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  43.7 
 
 
419 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  46.4 
 
 
373 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  45.83 
 
 
377 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  46.96 
 
 
447 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  46.96 
 
 
447 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  40.11 
 
 
400 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.37 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  48.7 
 
 
446 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  50.51 
 
 
430 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  53.1 
 
 
404 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  47.62 
 
 
431 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  44.12 
 
 
339 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  53 
 
 
454 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  52.83 
 
 
439 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  50.49 
 
 
443 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  53.77 
 
 
440 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  46.34 
 
 
301 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  53.91 
 
 
253 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  43.7 
 
 
524 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  50 
 
 
448 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  58.59 
 
 
332 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.96 
 
 
235 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  41.91 
 
 
360 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  41.91 
 
 
360 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  41.91 
 
 
360 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  45.74 
 
 
284 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  41.71 
 
 
442 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  50.91 
 
 
590 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  50.93 
 
 
297 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  43.61 
 
 
332 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  50.78 
 
 
379 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  48.25 
 
 
442 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  39.87 
 
 
299 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  40.58 
 
 
334 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.75 
 
 
377 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  48.48 
 
 
423 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  47.17 
 
 
308 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  41.91 
 
 
340 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  44.83 
 
 
308 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  51.35 
 
 
411 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  46.83 
 
 
238 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  51.96 
 
 
299 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  46.03 
 
 
238 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  57.58 
 
 
328 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  44.53 
 
 
399 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  49.59 
 
 
468 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  41.91 
 
 
340 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  42.47 
 
 
312 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  50.98 
 
 
299 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  41.91 
 
 
340 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  41.3 
 
 
324 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  46.77 
 
 
309 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  47.97 
 
 
316 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  52.43 
 
 
238 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  45.13 
 
 
445 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  47.5 
 
 
468 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  52.63 
 
 
414 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.53 
 
 
399 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  50 
 
 
382 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  44.44 
 
 
392 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  49.52 
 
 
582 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  44.19 
 
 
392 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.51 
 
 
376 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  37.63 
 
 
311 aa  105  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  44.53 
 
 
404 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  50.46 
 
 
751 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  50.98 
 
 
299 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  32.94 
 
 
276 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  49.57 
 
 
243 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  43.75 
 
 
415 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  53.27 
 
 
824 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>