More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4205 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  100 
 
 
236 aa  477  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  84.19 
 
 
237 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  40.8 
 
 
269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  36.75 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  48.44 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  49.6 
 
 
340 aa  126  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  48.44 
 
 
320 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  36.67 
 
 
351 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.41 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  45.76 
 
 
491 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  43.71 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  45.38 
 
 
458 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  39.26 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  39.26 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  39.26 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  41.72 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  49.15 
 
 
727 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  49.15 
 
 
727 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  46.85 
 
 
452 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  43.17 
 
 
383 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  41.52 
 
 
272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  38.98 
 
 
270 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  45.38 
 
 
266 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  43.51 
 
 
332 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  37.72 
 
 
288 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.76 
 
 
751 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  45.99 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  45.67 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  44 
 
 
340 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  35.23 
 
 
398 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  46.34 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  42.42 
 
 
229 aa  112  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  41.46 
 
 
442 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  49.59 
 
 
195 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  44 
 
 
340 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  44 
 
 
340 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  38.2 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  45.53 
 
 
198 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  41.14 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  44.55 
 
 
482 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.72 
 
 
326 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  43.94 
 
 
283 aa  109  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  42.21 
 
 
536 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  44.09 
 
 
468 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  45.24 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  46.67 
 
 
354 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  40.94 
 
 
339 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  46.77 
 
 
238 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  43.12 
 
 
447 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  43.12 
 
 
447 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  44.63 
 
 
358 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  42.2 
 
 
446 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  49.12 
 
 
300 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  45.45 
 
 
824 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  45.16 
 
 
357 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  38.41 
 
 
404 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  45 
 
 
349 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  47.22 
 
 
448 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  44.07 
 
 
377 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  36.26 
 
 
377 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  44.88 
 
 
754 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  43.56 
 
 
367 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  40.62 
 
 
321 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.44 
 
 
375 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  46.34 
 
 
199 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.04 
 
 
301 aa  101  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  40.91 
 
 
419 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  40.65 
 
 
352 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.9 
 
 
238 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.91 
 
 
379 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  34.86 
 
 
282 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  45.13 
 
 
316 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
590 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  46.49 
 
 
303 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  39.26 
 
 
645 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  44.72 
 
 
394 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.53 
 
 
453 aa  99.8  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  43.1 
 
 
294 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  41.32 
 
 
569 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  51.02 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  44.34 
 
 
445 aa  99.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  43.1 
 
 
292 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  40 
 
 
230 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  41.13 
 
 
333 aa  99.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  40.16 
 
 
233 aa  98.6  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  39.84 
 
 
430 aa  98.6  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  46.46 
 
 
441 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.72 
 
 
454 aa  98.2  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  32.8 
 
 
375 aa  98.2  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  42.4 
 
 
346 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  43.1 
 
 
291 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  45.08 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  39.32 
 
 
379 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  41.09 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  39.85 
 
 
651 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  44.83 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.38 
 
 
411 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  41.98 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  39.86 
 
 
360 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  43.1 
 
 
284 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>