More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10968 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  51.91 
 
 
360 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  51.61 
 
 
360 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  51.61 
 
 
360 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  49.56 
 
 
351 aa  285  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  49.86 
 
 
334 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  49.71 
 
 
348 aa  265  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  46.61 
 
 
340 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  46.61 
 
 
340 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  46.9 
 
 
340 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  48.43 
 
 
339 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  46.63 
 
 
339 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  50.54 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  59.2 
 
 
326 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  56.15 
 
 
245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  45.4 
 
 
224 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  56.25 
 
 
235 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  46.93 
 
 
346 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  55.74 
 
 
348 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  55.12 
 
 
406 aa  149  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  38.85 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  52.46 
 
 
199 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  56.06 
 
 
320 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  43.11 
 
 
251 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  52.42 
 
 
727 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  52.42 
 
 
727 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  51.64 
 
 
751 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  52.03 
 
 
311 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  50.42 
 
 
754 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  56.45 
 
 
271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  53.66 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  53.66 
 
 
311 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  50.41 
 
 
590 aa  129  9.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  50.82 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  42.44 
 
 
272 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  43.37 
 
 
198 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  49.58 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  43.37 
 
 
198 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  53.33 
 
 
195 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  53.33 
 
 
788 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  49.58 
 
 
452 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  48.28 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  47.15 
 
 
824 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  46.72 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  47.83 
 
 
383 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  41.61 
 
 
236 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  42.59 
 
 
491 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  33.33 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  42.86 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  47.54 
 
 
511 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  48.06 
 
 
283 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  45.67 
 
 
447 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  45.67 
 
 
447 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  48.03 
 
 
446 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  45.32 
 
 
266 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  41.67 
 
 
323 aa  105  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  43.94 
 
 
284 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  47.79 
 
 
448 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  41.53 
 
 
394 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  48.72 
 
 
442 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  46.83 
 
 
466 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  46.22 
 
 
445 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  43.65 
 
 
417 aa  103  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  37.58 
 
 
237 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  46.22 
 
 
524 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  43.61 
 
 
274 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  43.2 
 
 
398 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38 
 
 
376 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  47.41 
 
 
443 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  39.63 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  38.82 
 
 
300 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  46.22 
 
 
582 aa  99.8  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  36.71 
 
 
482 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  50.46 
 
 
291 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.72 
 
 
375 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  48 
 
 
539 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  50.46 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  50.46 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  48.62 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  48.36 
 
 
243 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  45.6 
 
 
697 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  45.6 
 
 
697 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  46.73 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.9 
 
 
238 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  32.08 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  44.78 
 
 
442 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  44.72 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  34.5 
 
 
441 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  35.94 
 
 
230 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  46.72 
 
 
238 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  47.06 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  44.8 
 
 
699 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.8 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  39.86 
 
 
674 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  42.74 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  42.28 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.22 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  38.93 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  43.59 
 
 
384 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.6 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>