More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3815 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  100 
 
 
237 aa  480  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  84.19 
 
 
236 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  41 
 
 
269 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  37.72 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  46.92 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  41.94 
 
 
229 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  45.05 
 
 
367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  45.83 
 
 
458 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45.9 
 
 
238 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  43.65 
 
 
468 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  41.67 
 
 
340 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.48 
 
 
442 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  48.15 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  36.56 
 
 
354 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  42.97 
 
 
251 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  38.29 
 
 
270 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  41.27 
 
 
491 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.01 
 
 
235 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  46.46 
 
 
375 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  44.92 
 
 
377 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  43.75 
 
 
320 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.14 
 
 
452 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  35.45 
 
 
404 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.52 
 
 
411 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  32.05 
 
 
321 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  43.85 
 
 
283 aa  101  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  46 
 
 
398 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  39.45 
 
 
446 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  42.86 
 
 
414 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  42.19 
 
 
332 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  44.83 
 
 
351 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  37.04 
 
 
360 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  37.04 
 
 
360 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  43.65 
 
 
271 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  37.04 
 
 
360 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  38.27 
 
 
348 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  43.8 
 
 
453 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  43.51 
 
 
284 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  40 
 
 
334 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  40.37 
 
 
447 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  40.37 
 
 
447 aa  99  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  40.91 
 
 
482 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  41.22 
 
 
383 aa  98.6  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  43.1 
 
 
340 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  41.86 
 
 
311 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  37.74 
 
 
272 aa  98.2  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  42.31 
 
 
379 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  38.31 
 
 
536 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  45.1 
 
 
443 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  44 
 
 
375 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  39.47 
 
 
412 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  41.88 
 
 
347 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  36.87 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  43.1 
 
 
340 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  43.1 
 
 
340 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  44.44 
 
 
448 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  44.92 
 
 
346 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  40 
 
 
377 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  42.86 
 
 
406 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  39.84 
 
 
352 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.56 
 
 
309 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  38.52 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  35.04 
 
 
541 aa  95.9  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  42.86 
 
 
454 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  46.46 
 
 
400 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  50 
 
 
238 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  37.09 
 
 
288 aa  95.5  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  45.45 
 
 
441 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  50 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  40.74 
 
 
372 aa  95.5  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  43.97 
 
 
339 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  39.47 
 
 
430 aa  95.1  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  43.1 
 
 
339 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  44.44 
 
 
431 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  43.48 
 
 
824 aa  94.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  36.65 
 
 
402 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  38.82 
 
 
400 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  38.82 
 
 
420 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 
349 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.5 
 
 
455 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  39.22 
 
 
421 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  38.4 
 
 
399 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  37.6 
 
 
399 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  39.22 
 
 
421 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  43.4 
 
 
676 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  37.93 
 
 
735 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  40.18 
 
 
358 aa  93.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  37.97 
 
 
460 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  40.28 
 
 
276 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  31.52 
 
 
375 aa  93.2  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.88 
 
 
326 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  36.75 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  41.8 
 
 
314 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  45.1 
 
 
727 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  45.92 
 
 
727 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  31.61 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  43.52 
 
 
300 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  40.37 
 
 
316 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  48.98 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  40.8 
 
 
346 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>