More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3592 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  100 
 
 		 321 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  53.85 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  49.72 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7995  Peptidase M23  43.56 
 
 		 536 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  43.42 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  43.42 
 
 		 348 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  45.67 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  34.98 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.85 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  40.62 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  54.05 
 
 		 669 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  32.05 
 
 		 237 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  39.74 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  39.74 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  39.74 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35.52 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  43.05 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  33.88 
 
 		 377 aa  99.4  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  45.76 
 
 		 482 aa  99.4  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  38.1 
 
 		 398 aa  99  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36.77 
 
 		 423 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  47.41 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.97 
 
 		 751 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.09 
 
 		 399 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.84 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  43.41 
 
 		 412 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  46.79 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  47.41 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  42.28 
 
 		 399 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  53.49 
 
 		 468 aa  96.3  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  44.19 
 
 		 425 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  47.96 
 
 		 467 aa  96.3  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  44.19 
 
 		 425 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  47.96 
 
 		 484 aa  95.9  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  48.25 
 
 		 352 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  38.04 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  43.41 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  43.41 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  39.63 
 
 		 340 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  38.67 
 
 		 231 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  39.08 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  39.72 
 
 		 453 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  46.67 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  43.41 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.64 
 
 		 420 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  41.07 
 
 		 402 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  40.25 
 
 		 339 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  42.4 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  48.45 
 
 		 377 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  36.47 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  47.71 
 
 		 527 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  44.35 
 
 		 824 aa  92.8  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  49.5 
 
 		 651 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  44.88 
 
 		 499 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  44.88 
 
 		 472 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  43.55 
 
 		 645 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  42.74 
 
 		 195 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  43.97 
 
 		 414 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  44.88 
 
 		 471 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  44.88 
 
 		 512 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.74 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  40.43 
 
 		 430 aa  90.9  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  42.74 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  41.13 
 
 		 727 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  41.13 
 
 		 727 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  47.92 
 
 		 375 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50.52 
 
 		 238 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  51.58 
 
 		 538 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  44.88 
 
 		 509 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  44.55 
 
 		 523 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  48.35 
 
 		 651 aa  89.7  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  41.13 
 
 		 383 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  48.35 
 
 		 651 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  40.97 
 
 		 455 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  42.86 
 
 		 229 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  44.88 
 
 		 470 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  44.76 
 
 		 648 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  45.83 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.86 
 
 		 235 aa  89.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  39.33 
 
 		 339 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  38.89 
 
 		 349 aa  88.6  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.3 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  41.67 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  45 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  49.47 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  47.96 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  40.94 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  39.31 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  39.31 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.59 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  38.82 
 
 		 454 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  38.64 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  39.06 
 
 		 590 aa  88.2  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  35.08 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  40.83 
 
 		 362 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  48.42 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  35.26 
 
 		 272 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  42.62 
 
 		 695 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.83 
 
 		 554 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  37.5 
 
 		 459 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>