More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2817 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  100 
 
 
339 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  87.02 
 
 
340 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  87.02 
 
 
340 aa  559  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  86.43 
 
 
340 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  82.65 
 
 
339 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  47.18 
 
 
351 aa  255  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  48.34 
 
 
334 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  48.38 
 
 
360 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  48.22 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  48.22 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  46.7 
 
 
348 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  55.98 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  56.05 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  51.83 
 
 
224 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  63.49 
 
 
235 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  61.98 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  58.59 
 
 
245 aa  165  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  60.17 
 
 
348 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  45.5 
 
 
340 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  55.74 
 
 
199 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  47.83 
 
 
346 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  51.94 
 
 
251 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  50.39 
 
 
406 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  51.61 
 
 
727 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  51.61 
 
 
727 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  51.97 
 
 
458 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  52.5 
 
 
751 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  55.37 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  53.85 
 
 
320 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  47.17 
 
 
272 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  51.67 
 
 
754 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  52.46 
 
 
452 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  53.72 
 
 
311 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  53.72 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  50.39 
 
 
824 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  48.46 
 
 
198 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  48.46 
 
 
198 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  49.59 
 
 
590 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  51.2 
 
 
271 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  49.6 
 
 
195 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  45.9 
 
 
358 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  44.54 
 
 
333 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  45.9 
 
 
349 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  50 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  45.22 
 
 
360 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  51.67 
 
 
788 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  49.09 
 
 
491 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  40.94 
 
 
236 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  44.7 
 
 
284 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  46.62 
 
 
383 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  43.28 
 
 
274 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  50.43 
 
 
269 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  46.46 
 
 
466 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  40.56 
 
 
323 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  44.54 
 
 
284 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  44.72 
 
 
300 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  41.91 
 
 
231 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  43.33 
 
 
582 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  42.52 
 
 
447 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  42.52 
 
 
447 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  33.18 
 
 
237 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  47.9 
 
 
283 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  43.33 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  43.33 
 
 
291 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  47.06 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  42.5 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  47.86 
 
 
442 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  43.8 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  38.89 
 
 
417 aa  97.8  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  43.09 
 
 
468 aa  96.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  43.75 
 
 
305 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  43.31 
 
 
446 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.44 
 
 
309 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  39.86 
 
 
379 aa  95.9  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  46.55 
 
 
443 aa  95.9  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.32 
 
 
321 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.77 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  43.7 
 
 
445 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  42.5 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  39.07 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  41.88 
 
 
482 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  42.97 
 
 
305 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.87 
 
 
300 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.97 
 
 
305 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  39.39 
 
 
419 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  44.25 
 
 
448 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  39.44 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  44.76 
 
 
354 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  42.02 
 
 
283 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  44.26 
 
 
367 aa  93.6  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.2 
 
 
301 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.5 
 
 
304 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  41.41 
 
 
247 aa  93.2  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  37.98 
 
 
274 aa  92.4  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  40.8 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  42.28 
 
 
316 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  44.26 
 
 
352 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  36 
 
 
291 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  43.7 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  38.86 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>