More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3326 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  100 
 
 
340 aa  683    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  38.4 
 
 
346 aa  182  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  40.43 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  45.55 
 
 
339 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  46.24 
 
 
339 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  39.71 
 
 
340 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  39.71 
 
 
340 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  56.59 
 
 
235 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  52.31 
 
 
360 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  52.31 
 
 
360 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  52.31 
 
 
360 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  54.55 
 
 
320 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  44.07 
 
 
224 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  46.15 
 
 
288 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  50.77 
 
 
332 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  51.15 
 
 
245 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  54.2 
 
 
251 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  53.78 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  43.23 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  54.2 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  50.39 
 
 
348 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  52.76 
 
 
458 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  48.06 
 
 
199 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  47.29 
 
 
351 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.08 
 
 
326 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  53.39 
 
 
311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  49.6 
 
 
236 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  47.24 
 
 
406 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  47.32 
 
 
751 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  48.28 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  48.28 
 
 
311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  45.69 
 
 
727 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  45.69 
 
 
727 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  33.33 
 
 
237 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  48.15 
 
 
754 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  48.25 
 
 
198 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  48.25 
 
 
198 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  40.44 
 
 
824 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  45.67 
 
 
283 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  49.15 
 
 
271 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  45.67 
 
 
321 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  34.87 
 
 
231 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  37.34 
 
 
269 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  42.75 
 
 
270 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40.87 
 
 
590 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  46.9 
 
 
195 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  46.73 
 
 
358 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.35 
 
 
452 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  42.97 
 
 
349 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  43.8 
 
 
569 aa  102  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  43.8 
 
 
491 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  42.34 
 
 
533 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  45.45 
 
 
527 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  48.28 
 
 
511 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  43.93 
 
 
333 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  38.73 
 
 
453 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.9 
 
 
442 aa  96.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  41.8 
 
 
414 aa  96.3  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  41.54 
 
 
383 aa  96.3  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  43.22 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  46.4 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  42.19 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  44.64 
 
 
468 aa  94.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.01 
 
 
243 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  43.36 
 
 
414 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  39.39 
 
 
676 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  41.27 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  38.64 
 
 
680 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  38.33 
 
 
323 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  41.13 
 
 
455 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  37.88 
 
 
681 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  41.13 
 
 
656 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  43.36 
 
 
402 aa  93.2  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  43.64 
 
 
229 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  44.72 
 
 
238 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  39.84 
 
 
399 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  43.44 
 
 
284 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  37.88 
 
 
687 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.84 
 
 
399 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  43.27 
 
 
354 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1368  peptidase M23  39.68 
 
 
434 aa  92.4  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  42.62 
 
 
352 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  39.39 
 
 
692 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  38.24 
 
 
271 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  40.48 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.3 
 
 
238 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  36.84 
 
 
362 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  37.65 
 
 
271 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  42.86 
 
 
466 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  47.32 
 
 
788 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  39.68 
 
 
447 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  39.68 
 
 
447 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  39.84 
 
 
238 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  38.1 
 
 
695 aa  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  38.89 
 
 
665 aa  90.9  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  38.64 
 
 
690 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  40.32 
 
 
455 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1104  peptidase M23B  48.45 
 
 
444 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109344  decreased coverage  0.00201556 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  40.16 
 
 
271 aa  90.5  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  32.54 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>