More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1340 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  100 
 
 		 346 aa  699    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  37.93 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  41.5 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  41.5 
 
 		 340 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  47.59 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  49.07 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  45.81 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  45.81 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  45.81 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  47.83 
 
 		 339 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  50.96 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  46.91 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  45.81 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  47.09 
 
 		 288 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  43.58 
 
 		 351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  51.26 
 
 		 199 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.87 
 
 		 235 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  40.32 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  52.07 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  48.74 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  47.86 
 
 		 224 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  47.06 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  50.82 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  48.55 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  43.62 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  47.54 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  45.1 
 
 		 236 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  49.14 
 
 		 751 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  48.31 
 
 		 727 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  48.31 
 
 		 727 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  48.53 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  49.56 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.44 
 
 		 452 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  49.55 
 
 		 311 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  49.55 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  46.49 
 
 		 824 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  49.02 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  38.58 
 
 		 270 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  43.61 
 
 		 383 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  47.37 
 
 		 754 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  32.76 
 
 		 237 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  44.74 
 
 		 198 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  43.86 
 
 		 198 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  47.37 
 
 		 195 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  47.71 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  47.15 
 
 		 283 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  41.88 
 
 		 590 aa  95.9  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  50 
 
 		 284 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  42.86 
 
 		 524 aa  95.9  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  38.41 
 
 		 491 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  40.3 
 
 		 429 aa  94.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  46.02 
 
 		 419 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  47.2 
 
 		 682 aa  94.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  42.86 
 
 		 674 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  33.51 
 
 		 459 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  33.76 
 
 		 269 aa  92.8  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  36.46 
 
 		 455 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  45.87 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  42.48 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  36.14 
 
 		 454 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  41.79 
 
 		 229 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  48.98 
 
 		 287 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  49.51 
 
 		 238 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  32.97 
 
 		 457 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  45.63 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  49.51 
 
 		 238 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  34.05 
 
 		 456 aa  89.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  36.07 
 
 		 681 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  46.9 
 
 		 231 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  42.86 
 
 		 676 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  40 
 
 		 527 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  36.81 
 
 		 223 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.66 
 
 		 430 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  38.55 
 
 		 340 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50.5 
 
 		 238 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1277  Peptidase M23  44.44 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376949  normal  0.138008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  43.75 
 
 		 697 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2268  Peptidase M23  44.72 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  46.74 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  43.75 
 
 		 697 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  44.04 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  42.86 
 
 		 699 aa  87  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.9 
 
 		 274 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  41.82 
 
 		 248 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  42.86 
 
 		 656 aa  87  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.26 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  41.09 
 
 		 233 aa  87  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  43.1 
 
 		 511 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  46.67 
 
 		 440 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  47.73 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  47.73 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  47.73 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  47.73 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  47.73 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  47.73 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.66 
 
 		 569 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  37.98 
 
 		 490 aa  86.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  47.73 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  47.73 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36 
 
 		 453 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>