More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1779 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  100 
 
 		 354 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  58.36 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  43.47 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  40.08 
 
 		 337 aa  172  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  43.75 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  50.45 
 
 		 482 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  50 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  50.48 
 
 		 824 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  49.09 
 
 		 582 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  40.54 
 
 		 754 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  46.55 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  39.58 
 
 		 446 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  41.79 
 
 		 442 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50.41 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  46.67 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  38.89 
 
 		 447 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  47.62 
 
 		 727 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  38.89 
 
 		 447 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  47.62 
 
 		 727 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  44.44 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  42.07 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  36.56 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  37.29 
 
 		 751 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  49.07 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46.61 
 
 		 411 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  42.98 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  48.11 
 
 		 270 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  43.44 
 
 		 350 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  47.75 
 
 		 352 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  45.31 
 
 		 414 aa  105  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.98 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  44.76 
 
 		 590 aa  104  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  42.98 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  44.26 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  42.62 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  47.17 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  29.8 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  51.43 
 
 		 351 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  47.17 
 
 		 195 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  45.71 
 
 		 198 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  42.06 
 
 		 465 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  44.83 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  42.66 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  46.67 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  46.34 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  46.34 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  45.54 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  46.55 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  44.74 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  46.34 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  42.06 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  44.76 
 
 		 198 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  41.38 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  38.67 
 
 		 454 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  42.36 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  39.35 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  50 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  43.24 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  48.57 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  42.62 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.4 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.97 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  48.7 
 
 		 273 aa  99.4  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  42.62 
 
 		 425 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  43.33 
 
 		 238 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  41.6 
 
 		 421 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  40.52 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  46.73 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  43.9 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.53 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  44.72 
 
 		 459 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.1 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  44.03 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  46.73 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.05 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  38.24 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  41.6 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  44.35 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  46.73 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.74 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  44.17 
 
 		 233 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  41.27 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  41.13 
 
 		 695 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  40.8 
 
 		 412 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  41.27 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  45.71 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  41.27 
 
 		 437 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  45.45 
 
 		 448 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  45.71 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.9 
 
 		 372 aa  96.3  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.38 
 
 		 238 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  46.73 
 
 		 332 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  42.37 
 
 		 298 aa  96.7  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  39.39 
 
 		 460 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  37.41 
 
 		 676 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  45.28 
 
 		 340 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  36.36 
 
 		 300 aa  95.9  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  37.6 
 
 		 271 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  46.6 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  46.34 
 
 		 238 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>