More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0085 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  100 
 
 
357 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  58.36 
 
 
354 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  44.56 
 
 
347 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  30.85 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  41.09 
 
 
269 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  45.16 
 
 
236 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  46.6 
 
 
824 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  29.58 
 
 
454 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  39.74 
 
 
447 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  39.74 
 
 
447 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50 
 
 
453 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  49.06 
 
 
491 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  43.93 
 
 
582 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.86 
 
 
452 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.14 
 
 
438 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  42.34 
 
 
297 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  43.93 
 
 
419 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  49 
 
 
392 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  49 
 
 
459 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  48 
 
 
392 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  49 
 
 
455 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  38.46 
 
 
446 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  35.47 
 
 
414 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  39.73 
 
 
270 aa  99.4  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  35.32 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  28.3 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  49 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  42.86 
 
 
442 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  47.41 
 
 
455 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  41.27 
 
 
293 aa  97.8  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38 
 
 
465 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  49.53 
 
 
687 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  42.99 
 
 
482 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  31.66 
 
 
223 aa  96.3  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  48 
 
 
457 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  41.13 
 
 
430 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  40.31 
 
 
317 aa  96.3  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  29.81 
 
 
317 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  38.56 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  42.59 
 
 
352 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  40 
 
 
458 aa  95.1  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  42.24 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  36.36 
 
 
450 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  43.33 
 
 
238 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  42.86 
 
 
233 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.74 
 
 
442 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.3 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  42.48 
 
 
301 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  42.65 
 
 
443 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  44.44 
 
 
271 aa  94  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  47.52 
 
 
231 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  40.74 
 
 
446 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  32.02 
 
 
299 aa  93.2  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  39.17 
 
 
271 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  36.13 
 
 
590 aa  92.8  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  44.44 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  43.22 
 
 
439 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  41.73 
 
 
415 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  36.51 
 
 
317 aa  92.8  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  39.52 
 
 
274 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  31.28 
 
 
333 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  44.25 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  39.02 
 
 
400 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  43.56 
 
 
358 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  43.22 
 
 
440 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  41.09 
 
 
237 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  40.91 
 
 
431 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  40.91 
 
 
431 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  40.91 
 
 
431 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  42.98 
 
 
362 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  45.45 
 
 
431 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  34.84 
 
 
541 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  46.32 
 
 
282 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  41.27 
 
 
273 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  37.11 
 
 
457 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  41.74 
 
 
376 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  42.98 
 
 
276 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  42.02 
 
 
298 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  43.59 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  40.78 
 
 
751 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  39.06 
 
 
253 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  38.61 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  40.38 
 
 
375 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  43.36 
 
 
433 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  40.77 
 
 
460 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  43.36 
 
 
433 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  43.36 
 
 
433 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  40.2 
 
 
754 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  43.36 
 
 
433 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  39.06 
 
 
283 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  39.53 
 
 
308 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  42.27 
 
 
727 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  44.55 
 
 
349 aa  89.4  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  38.58 
 
 
316 aa  89.7  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  42.27 
 
 
727 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  41.03 
 
 
247 aa  89.4  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  42.24 
 
 
419 aa  89.4  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  43.52 
 
 
523 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  37.72 
 
 
313 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  37.5 
 
 
249 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>