More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4473 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  100 
 
 		 491 aa  997    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  51.58 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  51.58 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  51.58 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  47.62 
 
 		 443 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  48.44 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.59 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  30.47 
 
 		 460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  30.43 
 
 		 454 aa  159  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  30.31 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  30.99 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  28.48 
 
 		 413 aa  157  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  31.72 
 
 		 456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  30.7 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  32.28 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  33.17 
 
 		 455 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  28.85 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  57.8 
 
 		 452 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  29.77 
 
 		 387 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  38.53 
 
 		 402 aa  144  5e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  30.79 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  47.97 
 
 		 229 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  31.27 
 
 		 392 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  30.16 
 
 		 384 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  54.95 
 
 		 727 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  54.95 
 
 		 727 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  30.39 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  54.05 
 
 		 751 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  35.27 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  42.77 
 
 		 301 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  52.07 
 
 		 419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  56.76 
 
 		 195 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  52.5 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  48.03 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  50.91 
 
 		 590 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  35.83 
 
 		 300 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  49.19 
 
 		 754 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  30.81 
 
 		 391 aa  127  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  52.25 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  53.1 
 
 		 198 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  46.21 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  53.7 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  55.05 
 
 		 582 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  52.25 
 
 		 824 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  52.21 
 
 		 198 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  50 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  45.39 
 
 		 349 aa  124  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  42.57 
 
 		 414 aa  124  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  53.04 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  48.76 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  46.09 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  43.29 
 
 		 300 aa  123  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  40.33 
 
 		 415 aa  123  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  46.67 
 
 		 482 aa  123  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  43.75 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  51.4 
 
 		 238 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  39.13 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  52.14 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  28.41 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  29.06 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  48.41 
 
 		 348 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  31.89 
 
 		 460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  40.76 
 
 		 288 aa  121  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  45.76 
 
 		 236 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  46.38 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  48.7 
 
 		 305 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  48.7 
 
 		 305 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  49.24 
 
 		 375 aa  120  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  48.7 
 
 		 305 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  46.38 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  47.89 
 
 		 313 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  52.29 
 
 		 445 aa  120  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  40.44 
 
 		 328 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  47.62 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  47.33 
 
 		 446 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  53.92 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  42.95 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  53.47 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  46.38 
 
 		 386 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  28.95 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  52.99 
 
 		 402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  48.39 
 
 		 398 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  51.85 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  46.21 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  51.33 
 
 		 511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  46.09 
 
 		 303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  51.33 
 
 		 465 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  52.07 
 
 		 284 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  50.44 
 
 		 457 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  48.78 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  46.34 
 
 		 406 aa  117  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  40.43 
 
 		 262 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  47.01 
 
 		 274 aa  117  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  44.2 
 
 		 360 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.54 
 
 		 326 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  50.86 
 
 		 334 aa  116  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  48.7 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  48.7 
 
 		 431 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  47.54 
 
 		 402 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  50.46 
 
 		 300 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>