More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3272 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  100 
 
 		 459 aa  944    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  33.11 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  30.25 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  31.12 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  32.33 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  31.35 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  29.66 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  32.84 
 
 		 456 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  31.72 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  30.18 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  29.17 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  29.44 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  28.01 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  27.71 
 
 		 439 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  29.32 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  29.95 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  28.99 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  29.93 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  28.3 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  29.23 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  29.23 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  28.6 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  31.51 
 
 		 391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  35.8 
 
 		 387 aa  153  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  31.11 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  30.31 
 
 		 491 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  28.11 
 
 		 442 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  37.12 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  40.94 
 
 		 303 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  30 
 
 		 382 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  38.34 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  37.37 
 
 		 415 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  35.15 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  46.46 
 
 		 319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  33.74 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  45.19 
 
 		 229 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  44.31 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  43.71 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  43.71 
 
 		 299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  33.47 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  45.32 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  41.98 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  41.67 
 
 		 315 aa  128  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  46.46 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  46.51 
 
 		 313 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  43.11 
 
 		 299 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  43.11 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  34.14 
 
 		 305 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  37.82 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  34.14 
 
 		 305 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  43.64 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  43.71 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.74 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  43.64 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  43.64 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  39.31 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  44.7 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  34.26 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  41.18 
 
 		 299 aa  123  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  36.09 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  36.26 
 
 		 288 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  45.45 
 
 		 299 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  33.06 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  42.51 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  42.51 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  42.51 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  42.51 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  41.61 
 
 		 309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  51.28 
 
 		 375 aa  120  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  33.73 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  40.72 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.86 
 
 		 282 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  44.88 
 
 		 448 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  44.7 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  46.96 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  40.66 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  41.1 
 
 		 233 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  48.28 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  35.92 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  33.01 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  45.45 
 
 		 243 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  44.26 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  38.3 
 
 		 318 aa  117  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  46.96 
 
 		 582 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  48.28 
 
 		 524 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  43.7 
 
 		 238 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  38.41 
 
 		 312 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  44.35 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  43.7 
 
 		 238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  45.53 
 
 		 379 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  45.9 
 
 		 316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  42.19 
 
 		 305 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  38.51 
 
 		 238 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  45.08 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  43.48 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  40 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  48.25 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  43.75 
 
 		 305 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.94 
 
 		 452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  40 
 
 		 299 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>